More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0049 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0049  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
337 aa  687    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  33.43 
 
 
333 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 
337 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.26 
 
 
341 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 
343 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.65 
 
 
336 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 
341 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.3 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  33.72 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  33.14 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  38.01 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  38.01 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.01 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  38.01 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.01 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.01 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.26 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.01 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.01 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.99 
 
 
333 aa  182  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.07 
 
 
341 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.97 
 
 
341 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  36.42 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.25 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.13 
 
 
341 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.13 
 
 
341 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.13 
 
 
341 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.13 
 
 
341 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.13 
 
 
341 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.73 
 
 
330 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 
348 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.95 
 
 
336 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  34.49 
 
 
338 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 
330 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.81 
 
 
341 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 
330 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 
339 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.27 
 
 
341 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.65 
 
 
332 aa  175  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 
330 aa  175  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.13 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  36.31 
 
 
338 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.56 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  36.45 
 
 
338 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.67 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.67 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.67 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.84 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.95 
 
 
340 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 
340 aa  173  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.62 
 
 
335 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  35.09 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.4 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  33.13 
 
 
330 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 
339 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.01 
 
 
339 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  33.13 
 
 
330 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  34.87 
 
 
341 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  32.94 
 
 
333 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 
332 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 
339 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  34.35 
 
 
332 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.67 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.46 
 
 
337 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  36.58 
 
 
343 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 
343 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.72 
 
 
336 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 
337 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.98 
 
 
347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  32.34 
 
 
333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.28 
 
 
335 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 
336 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  31.96 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.12 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  33.04 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  34.29 
 
 
355 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  33.04 
 
 
332 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  32.74 
 
 
332 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  32.44 
 
 
332 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  36.61 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  34.27 
 
 
352 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  32.74 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 
335 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  32.64 
 
 
342 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.09 
 
 
353 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 
339 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.27 
 
 
333 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.86 
 
 
331 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 
353 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  34.01 
 
 
352 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 
336 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.56 
 
 
346 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>