More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3413 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 340 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  93.24 
 
 		 340 aa  630  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  66.28 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  65.69 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  58.06 
 
 		 343 aa  359  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  59.36 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  57.89 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  49.27 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  44.67 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  40.12 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  38.19 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  38.01 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  36.55 
 
 		 354 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  37.13 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  38.89 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  33.99 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  31.88 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  32.17 
 
 		 343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  36.21 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  34.11 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  36.99 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  35.09 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  32.56 
 
 		 342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  32.36 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  35.9 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 		 348 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  32.6 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  32.84 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  33.88 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  34.29 
 
 		 363 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  31.09 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  31.86 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  31.31 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  30.3 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  33.75 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  32.17 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  29.45 
 
 		 330 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  27.89 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  25.47 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  30.46 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  27.53 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  30.26 
 
 		 368 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  26.42 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0778  LacI family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.602381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  24.19 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.08 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.96 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  23.49 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  30.94 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  29.61 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  26.48 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  27.31 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  42.35 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  32.11 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  28.23 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27.1 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1692  LacI family transcription regulator  29.44 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.16 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  24.89 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.18 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1526  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.114079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  26.75 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  27.36 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  43.94 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.59 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  26.34 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  26.34 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  26.34 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  28.94 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  55.17 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  28.07 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>