More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1692 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1692  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 343 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  42.34 
 
 		 357 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  40.9 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0764  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.36 
 
 		 348 aa  252  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4590  LacI family transcription regulator  40.55 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3409  LacI family transcription regulator  40.91 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000197592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1347  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2029  HTH-type transcriptional repressor  39.62 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.169196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4504  regulatory protein, LacI  39.27 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0805  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.75 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6427  transcriptional regulator, LacI family  38.37 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6244  transcriptional regulator, LacI family  36.97 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  37.34 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5195  transcriptional regulator LacI family  36.04 
 
 		 358 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1562  LacI family transcription regulator  33.76 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5762  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 		 365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6127  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 		 365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.401704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1382  LacI family transcription regulator  37.73 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.641116 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6609  LacI family transcription regulator  36.97 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.423679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1342  LacI family transcription regulator  37.42 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7624  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1046  regulatory protein, LacI  35.01 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  38.53 
 
 		 347 aa  188  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  36.21 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  36.13 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  35.81 
 
 		 340 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  34.09 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  34.38 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  30.33 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0485  transcriptional repressor, LacI family  35.47 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  34.45 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  31.73 
 
 		 364 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4696  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.19 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 375 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  34.45 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.73 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  34.09 
 
 		 343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  34.91 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.96 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  31.91 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.65 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.22 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.92 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.11 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.83 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.4 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.03 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.24 
 
 		 356 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.02 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 346 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 346 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  33.83 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.1 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  31.34 
 
 		 335 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  29.85 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  31.52 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  32.42 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.04 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.73 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.84 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  33.94 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  30.7 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  28.66 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  31.42 
 
 		 338 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>