More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3695 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  100 
 
 
375 aa  750    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  78.9 
 
 
345 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  78.03 
 
 
345 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  78.03 
 
 
345 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  74.41 
 
 
335 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  70.06 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  70.06 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  52.02 
 
 
336 aa  338  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  50.14 
 
 
349 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  52.55 
 
 
356 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  53.09 
 
 
358 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1589  alanine racemase  53.23 
 
 
348 aa  285  8e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000384981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.11 
 
 
382 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  44.51 
 
 
337 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  43.67 
 
 
359 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  39.71 
 
 
335 aa  222  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  38.42 
 
 
364 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 
351 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  41.42 
 
 
334 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0311  LacI family transcription regulator  38.87 
 
 
340 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  37.93 
 
 
350 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  36.68 
 
 
355 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.01 
 
 
339 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  36.26 
 
 
340 aa  203  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  36.6 
 
 
332 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  36.36 
 
 
332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  37.54 
 
 
345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 
335 aa  199  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  36.18 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  40.48 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  38.7 
 
 
339 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  38.71 
 
 
341 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  35.57 
 
 
357 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  38.71 
 
 
341 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  35.39 
 
 
331 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  35.18 
 
 
337 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  39.94 
 
 
348 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  35.86 
 
 
356 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  36.52 
 
 
340 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  35.99 
 
 
345 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.99 
 
 
345 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  36.1 
 
 
340 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 
364 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  37.12 
 
 
345 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  35.39 
 
 
343 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  38.1 
 
 
347 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  36.16 
 
 
344 aa  190  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  33.23 
 
 
350 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1978  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.12 
 
 
339 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  34.71 
 
 
341 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  38.01 
 
 
343 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  38.39 
 
 
354 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  38.39 
 
 
343 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  37.83 
 
 
346 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.44 
 
 
331 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.44 
 
 
331 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 
340 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  34.45 
 
 
339 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  34.45 
 
 
339 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  34.45 
 
 
339 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  34.45 
 
 
339 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  34.45 
 
 
339 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  35.23 
 
 
351 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.54 
 
 
356 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  35.23 
 
 
351 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  35.23 
 
 
351 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  36.59 
 
 
388 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  39.45 
 
 
339 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  41.18 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  34.49 
 
 
332 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 
343 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  32.24 
 
 
333 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  32.32 
 
 
335 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  38.06 
 
 
349 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  32.9 
 
 
335 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 
339 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  33.77 
 
 
336 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  37.79 
 
 
339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 
342 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 
348 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  38.71 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 
343 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.76 
 
 
355 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 
345 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  37.46 
 
 
339 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  34.68 
 
 
338 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4217  LacI family transcription regulator  37.62 
 
 
335 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  34.09 
 
 
353 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2346  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 
341 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  34.09 
 
 
331 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  34.09 
 
 
353 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  34.09 
 
 
353 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  34.09 
 
 
353 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 
323 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3637  transcriptional regulator GntR  34.42 
 
 
331 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.4011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>