More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4193 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 338 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 338 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  77.31 
 
 		 345 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  77.01 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  77.01 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  70.06 
 
 		 375 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  68.15 
 
 		 335 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  53.5 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  52.58 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  52.69 
 
 		 349 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  51.63 
 
 		 336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  48.57 
 
 		 337 aa  298  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1589  alanine racemase  55.92 
 
 		 348 aa  289  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000384981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.61 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  41.92 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  41.95 
 
 		 351 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  40.71 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  39.7 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  40.95 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  41.54 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  41.07 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  39.63 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  40.79 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  40.73 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  39.22 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  38.48 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  39.14 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  41.84 
 
 		 348 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  37.95 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  40.52 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.95 
 
 		 364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  37.87 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  33.53 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  37.23 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  37.98 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  37.98 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.58 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  37 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  36.72 
 
 		 338 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0311  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  35.76 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  35.76 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  35.76 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  35.76 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  35.76 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  39.6 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.46 
 
 		 355 aa  185  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  34.18 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2346  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  38.56 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  32.68 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  39.04 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  36.34 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  38.69 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  34.73 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 345 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  34.85 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  32.18 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4217  LacI family transcription regulator  36.51 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  37.37 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  34.04 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  36.3 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  36.3 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.69 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  38.26 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  31.56 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  35.94 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  35.94 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  35.97 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  32.69 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.69 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  36.27 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.22 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  33.12 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.22 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  35.62 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.62 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  34.26 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>