More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4508 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 356 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  92.09 
 
 		 358 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  66.45 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  57.74 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  54.38 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  54.38 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  54.38 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  52.87 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  52.58 
 
 		 338 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  52.58 
 
 		 338 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  53.54 
 
 		 335 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  52.55 
 
 		 375 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1589  alanine racemase  50.99 
 
 		 348 aa  288  7e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000384981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.54 
 
 		 382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  40.53 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  40.9 
 
 		 331 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  40.83 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  40.84 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  38.97 
 
 		 340 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  39.2 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  37.64 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  36.63 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  35.75 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  36.07 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  37.27 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  39.13 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  35.33 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  36.9 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  36.26 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  36.64 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  37.75 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  36.16 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2346  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  37.68 
 
 		 348 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0311  LacI family transcription regulator  35.62 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.04 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  34.83 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  34.77 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  34.77 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 345 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  34.77 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  34.77 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  34.77 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  35.9 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.9 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  35.58 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  35.59 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  34.67 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  32.94 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  38.55 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  38.55 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1978  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.97 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  35.83 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.73 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  33.97 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0764  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0872  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.12 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3831  LacI family transcription regulator  35.1 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  36.75 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  32.63 
 
 		 333 aa  179  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 364 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 343 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  35.34 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  33.03 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  35.18 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.1 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  35.24 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  33.86 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.6 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  36.16 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  32.56 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1347  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0328  LacI family transcription regulator  34.2 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  29.64 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  32.03 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>