More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4642 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 331 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  80.97 
 
 		 343 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  66.47 
 
 		 334 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  55.76 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  54.1 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  53.94 
 
 		 347 aa  331  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  50.91 
 
 		 332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  53.85 
 
 		 351 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  47.45 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 351 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 351 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 351 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  49.55 
 
 		 351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  46.41 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  49.23 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  48.63 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  48.93 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  46.88 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3831  LacI family transcription regulator  41.9 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167541  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  40.9 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  39.52 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.3 
 
 		 382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  42.51 
 
 		 388 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  40.95 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  40.95 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  39.59 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.6 
 
 		 339 aa  215  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  39.38 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  39.13 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  39.14 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  38.67 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  38.67 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  39.82 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  38.46 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 348 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 339 aa  199  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  34.44 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2432  alanine racemase  38.37 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  38.37 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0764  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  36.31 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  40.14 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.6 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  36.31 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.53 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2346  LacI family transcription regulator  37.29 
 
 		 341 aa  189  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2627  LacI family transcription regulator  37.42 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  36.59 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  32.22 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  37.61 
 
 		 338 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1978  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.54 
 
 		 339 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0872  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  36.02 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  33.84 
 
 		 345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.41 
 
 		 356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  38.53 
 
 		 335 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  31 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 343 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  36.39 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  33.97 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  35.28 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  30.06 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 346 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  29.73 
 
 		 337 aa  175  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0311  LacI family transcription regulator  34.49 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  30.46 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  34.45 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  34.45 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1589  alanine racemase  39.47 
 
 		 348 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000384981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  36.61 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0328  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  30.12 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  35.12 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  30.75 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  30.34 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  31.6 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  34.1 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5013  transcriptional regulator, LacI family  37.12 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771857  normal  0.165296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.5 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.5 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  34.43 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.43 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 359 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>