More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4299 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  100 
 
 
348 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  40.4 
 
 
343 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  40.36 
 
 
332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  40.23 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 
340 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  40.12 
 
 
350 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  42.52 
 
 
338 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  42.52 
 
 
338 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  43.92 
 
 
335 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  40.23 
 
 
355 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  39.18 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 
331 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  37.68 
 
 
356 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 
347 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  37.78 
 
 
358 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  39.09 
 
 
340 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  39.09 
 
 
340 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  37.21 
 
 
351 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  37.21 
 
 
351 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  37.21 
 
 
351 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  37.21 
 
 
351 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  39.21 
 
 
334 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 
343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 
345 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 
345 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  40.5 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 
345 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 
364 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  37.87 
 
 
348 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  37.76 
 
 
337 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  35.86 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  38.62 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2346  LacI family transcription regulator  36.26 
 
 
341 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  38.36 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  37.79 
 
 
335 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  39.46 
 
 
351 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  37.76 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  32.72 
 
 
333 aa  196  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 
335 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  34.45 
 
 
331 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.67 
 
 
339 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  36.9 
 
 
339 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  32.82 
 
 
350 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.65 
 
 
382 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  37.93 
 
 
339 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  37.93 
 
 
339 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  37.93 
 
 
339 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  37.93 
 
 
339 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  37.62 
 
 
339 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  36.07 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  35.56 
 
 
344 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  30.79 
 
 
341 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  31.19 
 
 
335 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  37.87 
 
 
388 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  39.26 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  36.64 
 
 
345 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 
339 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 
342 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  37.35 
 
 
345 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  37.18 
 
 
345 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.18 
 
 
345 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  38.76 
 
 
343 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1589  alanine racemase  39.04 
 
 
348 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000384981  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1978  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.05 
 
 
339 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  31.98 
 
 
356 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.72 
 
 
332 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  30.25 
 
 
337 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  32.41 
 
 
336 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  36.23 
 
 
338 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  34.43 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  30.28 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.71 
 
 
331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  31.5 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  34.41 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  36.18 
 
 
338 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 
359 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.34 
 
 
364 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  32.1 
 
 
332 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  37.2 
 
 
335 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  33.75 
 
 
332 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.1 
 
 
332 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.4 
 
 
331 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0311  LacI family transcription regulator  34.39 
 
 
340 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.5 
 
 
356 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 
336 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0224  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 
332 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 
349 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  32.32 
 
 
343 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 
332 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04130  DNA-binding transcriptional repressor, 5-gluconate-binding  30.4 
 
 
332 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.845114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3733  transcriptional regulator, LacI family  30.4 
 
 
332 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4520  transcriptional regulator IdnR  30.4 
 
 
332 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000192749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4829  HTH-type transcriptional regulator IdnR  30.37 
 
 
332 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1692  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 
343 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3831  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 
340 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4766  HTH-type transcriptional regulator IdnR  30.37 
 
 
332 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4745  transcriptional regulator IdnR  30.4 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>