More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  99.71 
 
 		 354 aa  683    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  100 
 
 		 343 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  78.72 
 
 		 343 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  81.92 
 
 		 343 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  65.87 
 
 		 338 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  64.67 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  61.65 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  66.96 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  67.07 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  66.77 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  63.66 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  66.47 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  54.41 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  56.5 
 
 		 346 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  53.96 
 
 		 341 aa  359  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  53.96 
 
 		 341 aa  359  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  54.81 
 
 		 343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  50.44 
 
 		 344 aa  346  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  56.76 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0328  LacI family transcription regulator  53.87 
 
 		 341 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.15 
 
 		 339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  47.59 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  41.21 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  39.63 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  44.14 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  41.46 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  39.94 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  37.72 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0265  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.01376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  40.73 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.94 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  37.94 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  38.41 
 
 		 335 aa  232  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.94 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.11 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.11 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  36.89 
 
 		 350 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  37.96 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  39.09 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  39.09 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  39.09 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  39.09 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  39.38 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0277  transcriptional regulator, LacI family  39.69 
 
 		 331 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4754  transcriptional regulator GntR  39.69 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  0.56413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3721  transcriptional regulator GntR  39.69 
 
 		 331 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0275  LacI family transcription regulator  39.69 
 
 		 331 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3637  transcriptional regulator GntR  39.69 
 
 		 331 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.4011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  42.78 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3846  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.58256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03289  DNA-binding transcriptional repressor  39.38 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03242  hypothetical protein  39.38 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3916  transcriptional regulator GntR  39.38 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  36.11 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3887  transcriptional regulator GntR  39.38 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.917032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2432  alanine racemase  42.12 
 
 		 365 aa  215  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  42.09 
 
 		 355 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  38.53 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  38.17 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  38.17 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0134  LacI family transcription regulator  35.6 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  38.17 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  33.54 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  39.3 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.2 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  38.19 
 
 		 343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  41.28 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  38.53 
 
 		 351 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4766  HTH-type transcriptional regulator IdnR  35.89 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0872  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0764  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0224  transcriptional regulator, LacI family  34.36 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4829  HTH-type transcriptional regulator IdnR  35.89 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  37.98 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  37.98 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  38.34 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4885  HTH-type transcriptional regulator IdnR  35.58 
 
 		 332 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4736  HTH-type transcriptional regulator IdnR  35.58 
 
 		 332 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4866  HTH-type transcriptional regulator IdnR  35.58 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0303981  normal  0.118687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  38.02 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.02 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  37.05 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  37.38 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1978  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.27 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3289  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>