More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6417 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 358 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  92.09 
 
 		 356 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  61.56 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  56.85 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  53.47 
 
 		 345 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  53.78 
 
 		 345 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  53.78 
 
 		 345 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  53.5 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  53.5 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  51.82 
 
 		 337 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  53.87 
 
 		 335 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  53.09 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1589  alanine racemase  50.99 
 
 		 348 aa  293  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000384981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.95 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  40.36 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  38.89 
 
 		 343 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  39.52 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  39.09 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  39.27 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  39.16 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  38.04 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  37.16 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  36.71 
 
 		 356 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  36.86 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  39.16 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  37.21 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  38.22 
 
 		 355 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  39.34 
 
 		 335 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  38.02 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  35.33 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  36.42 
 
 		 350 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  35.78 
 
 		 351 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  35.53 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  36 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  36.48 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  39.13 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  36.67 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.55 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2346  LacI family transcription regulator  37.28 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0311  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  37.78 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  33.13 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  36.26 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  35.26 
 
 		 339 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  35.26 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  35.26 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  35.26 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  35.26 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  32.74 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  37.76 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  37.76 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 		 332 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  32.22 
 
 		 332 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.22 
 
 		 332 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  32.05 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  34.49 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  34.83 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  34.29 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.61 
 
 		 332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  33.43 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1978  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.19 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  33.95 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  37.07 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  34.29 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.29 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  33.87 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.13 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  36.56 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3831  LacI family transcription regulator  37.67 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  33.24 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.99 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.82 
 
 		 356 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0764  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  35.83 
 
 		 349 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  35.35 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  30.63 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0872  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  34.9 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  34.67 
 
 		 343 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  35.5 
 
 		 335 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 343 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>