More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00507 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  100 
 
 
335 aa  688    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  91.64 
 
 
335 aa  636    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  80.06 
 
 
332 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  69.39 
 
 
337 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  54.52 
 
 
336 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  53.31 
 
 
332 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  53.01 
 
 
332 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  53.31 
 
 
332 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  53.31 
 
 
332 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  53.03 
 
 
332 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  50.61 
 
 
331 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  50.61 
 
 
343 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  50.61 
 
 
331 aa  359  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  49.7 
 
 
350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  50.91 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0265  transcriptional regulator, LacI family  51.52 
 
 
331 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.01376  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0277  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 
331 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3637  transcriptional regulator GntR  49.7 
 
 
331 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.4011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3721  transcriptional regulator GntR  49.7 
 
 
331 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0275  LacI family transcription regulator  49.7 
 
 
331 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4754  transcriptional regulator GntR  49.7 
 
 
331 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  0.56413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3846  LacI family transcription regulator  50.45 
 
 
331 aa  349  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.58256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03289  DNA-binding transcriptional repressor  49.39 
 
 
331 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58674  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3916  transcriptional regulator GntR  49.39 
 
 
331 aa  347  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03242  hypothetical protein  49.39 
 
 
331 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  49.09 
 
 
353 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  49.09 
 
 
353 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  49.09 
 
 
331 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  49.09 
 
 
353 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  49.09 
 
 
353 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3887  transcriptional regulator GntR  49.09 
 
 
331 aa  343  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.917032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 
332 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  47.43 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0134  LacI family transcription regulator  49.04 
 
 
312 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4745  transcriptional regulator IdnR  44.41 
 
 
332 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21306  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04130  DNA-binding transcriptional repressor, 5-gluconate-binding  44.71 
 
 
332 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.845114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3733  transcriptional regulator, LacI family  44.71 
 
 
332 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4520  transcriptional regulator IdnR  44.71 
 
 
332 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000192749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4829  HTH-type transcriptional regulator IdnR  43.5 
 
 
332 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4766  HTH-type transcriptional regulator IdnR  43.2 
 
 
332 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280559  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4885  HTH-type transcriptional regulator IdnR  42.9 
 
 
332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4736  HTH-type transcriptional regulator IdnR  42.9 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4866  HTH-type transcriptional regulator IdnR  42.9 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0303981  normal  0.118687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0224  transcriptional regulator, LacI family  43.5 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  41.57 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1796  L-idonate regulatory protein  43.03 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.248054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3289  LacI family transcription regulator  42.6 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1578  LacI family transcription regulator  42.73 
 
 
330 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1473  L-idonate regulatory protein  42.12 
 
 
330 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 
356 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  38.41 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  38.41 
 
 
343 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 
364 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 
335 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 
344 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 
343 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 
343 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.15 
 
 
364 aa  208  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 
343 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2432  alanine racemase  35.35 
 
 
365 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 
339 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  34.65 
 
 
338 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  35.37 
 
 
349 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 
339 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  36.64 
 
 
388 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  35.06 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.94 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  34.76 
 
 
339 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  34.04 
 
 
338 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 
339 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  34.45 
 
 
364 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 
339 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  34.77 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  34.06 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  32.13 
 
 
341 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 
341 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  32.62 
 
 
339 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  32.42 
 
 
341 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0872  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 
341 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 
357 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0764  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 
345 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518847  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4217  LacI family transcription regulator  35.02 
 
 
335 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  32.93 
 
 
342 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
336 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.67 
 
 
356 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 
345 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  31.89 
 
 
349 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 
345 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  29.88 
 
 
345 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 
345 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.09 
 
 
345 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0311  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 
340 aa  186  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  32.14 
 
 
356 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2627  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 
349 aa  185  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  32.13 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0328  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 
341 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 
341 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.77717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>