More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02173 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 350 aa  688    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  55.49 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  55.65 
 
 		 347 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  55.02 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  53.21 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  48.07 
 
 		 355 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  49.23 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  47.92 
 
 		 334 aa  312  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  47.92 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  51.23 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 351 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 351 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 351 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  45.23 
 
 		 351 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  45.85 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  46.18 
 
 		 340 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  45.54 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  46.81 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  46.93 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.71 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  37.36 
 
 		 364 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  37.97 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3831  LacI family transcription regulator  38.04 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167541  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 358 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  37.27 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  37.93 
 
 		 375 aa  215  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  37.1 
 
 		 345 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  37.1 
 
 		 345 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  40.12 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 348 aa  212  9e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  34.27 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  36.05 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  36.5 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.18 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  38.74 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  37.84 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  36.45 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  38.19 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  39.08 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  35.63 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 364 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  35.42 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  35.42 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  35.42 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  35.42 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  35.42 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  35.31 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  35.63 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2346  LacI family transcription regulator  35.41 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  33.13 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1589  alanine racemase  37.83 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000384981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2432  alanine racemase  37.54 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2627  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 		 349 aa  175  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  36 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  33.12 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  33.93 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  30.97 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  32.34 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  33.63 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  34.91 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 		 339 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  29.28 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  29.76 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  32.64 
 
 		 344 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.69 
 
 		 356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1692  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  28.97 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  32.66 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  32.81 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0872  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  34.15 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.52 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4520  transcriptional regulator IdnR  29.01 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000192749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1978  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.55 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04130  DNA-binding transcriptional repressor, 5-gluconate-binding  29.01 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.845114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3733  transcriptional regulator, LacI family  29.01 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0764  transcriptional regulator, LacI family  30.15 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4745  transcriptional regulator IdnR  28.4 
 
 		 332 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>