More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0927 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 335 aa  671    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  42.99 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  44.14 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  45.03 
 
 		 337 aa  282  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  44.51 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  43.48 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  42.22 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  43.75 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  44.04 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  45.48 
 
 		 364 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0265  transcriptional regulator, LacI family  43.83 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.01376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.07 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  42.07 
 
 		 332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  42.07 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.07 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  43.64 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  42.86 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  41.49 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  40.87 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 331 aa  265  8.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  42.11 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0277  transcriptional regulator, LacI family  42.24 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3721  transcriptional regulator GntR  42.24 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  41.61 
 
 		 353 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  41.61 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0275  LacI family transcription regulator  42.24 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3637  transcriptional regulator GntR  42.24 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.4011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  41.61 
 
 		 353 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  41.61 
 
 		 353 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  41.61 
 
 		 353 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4754  transcriptional regulator GntR  42.24 
 
 		 331 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  0.56413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  44.74 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3887  transcriptional regulator GntR  41.93 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.917032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03289  DNA-binding transcriptional repressor  41.93 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58674  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3916  transcriptional regulator GntR  41.93 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03242  hypothetical protein  41.93 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3846  LacI family transcription regulator  42.72 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.58256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0134  LacI family transcription regulator  40.26 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.15 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  44.14 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  41.74 
 
 		 344 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  43.84 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  41.19 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  41.12 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  41.19 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2432  alanine racemase  44.74 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  43.15 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  41.34 
 
 		 357 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0224  transcriptional regulator, LacI family  38.58 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.9 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  41.57 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  39.17 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  37.24 
 
 		 339 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  37.24 
 
 		 339 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  37.24 
 
 		 339 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  37.24 
 
 		 339 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  37.24 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04130  DNA-binding transcriptional repressor, 5-gluconate-binding  37.73 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.845114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3733  transcriptional regulator, LacI family  37.73 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4520  transcriptional regulator IdnR  37.73 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000192749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.71 
 
 		 356 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  41.06 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4745  transcriptional regulator IdnR  38.04 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  41.12 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  41.12 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4829  HTH-type transcriptional regulator IdnR  38.04 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  43.84 
 
 		 343 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  41.44 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  41.12 
 
 		 345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4736  HTH-type transcriptional regulator IdnR  37.73 
 
 		 332 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4885  HTH-type transcriptional regulator IdnR  37.73 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4766  HTH-type transcriptional regulator IdnR  37.73 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4866  HTH-type transcriptional regulator IdnR  37.73 
 
 		 332 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0303981  normal  0.118687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  39.71 
 
 		 375 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  34.93 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  42.99 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  39.34 
 
 		 358 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0328  LacI family transcription regulator  42.64 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  40.52 
 
 		 345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.6 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  39.39 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  38.84 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  39.34 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  36.92 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.22 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  41.55 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  37.85 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  39.2 
 
 		 355 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  39.14 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1441  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.21 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>