More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03289 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03289  DNA-binding transcriptional repressor  100 
 
 		 331 aa  679    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0275  LacI family transcription regulator  99.7 
 
 		 331 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0277  transcriptional regulator, LacI family  99.7 
 
 		 331 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3721  transcriptional regulator GntR  99.7 
 
 		 331 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  96.98 
 
 		 353 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  96.98 
 
 		 331 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  96.98 
 
 		 353 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  96.98 
 
 		 353 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3637  transcriptional regulator GntR  99.7 
 
 		 331 aa  676    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.4011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  96.98 
 
 		 353 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3887  transcriptional regulator GntR  98.79 
 
 		 331 aa  669    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.917032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4754  transcriptional regulator GntR  99.4 
 
 		 331 aa  675    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  0.56413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3916  transcriptional regulator GntR  100 
 
 		 331 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3846  LacI family transcription regulator  94.26 
 
 		 331 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.58256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03242  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  679    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  80.06 
 
 		 343 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  79.15 
 
 		 331 aa  554  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  79.15 
 
 		 331 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0134  LacI family transcription regulator  78.21 
 
 		 312 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  74.32 
 
 		 331 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  73.41 
 
 		 332 aa  511  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  72.51 
 
 		 332 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0265  transcriptional regulator, LacI family  71.9 
 
 		 331 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.01376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  62.42 
 
 		 336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  60 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  60 
 
 		 332 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  60 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  59.7 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  58.61 
 
 		 350 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  53.64 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  50 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  49.39 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  50 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  50 
 
 		 332 aa  346  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4520  transcriptional regulator IdnR  46.08 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000192749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04130  DNA-binding transcriptional repressor, 5-gluconate-binding  46.08 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.845114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3733  transcriptional regulator, LacI family  46.08 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4745  transcriptional regulator IdnR  46.08 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0224  transcriptional regulator, LacI family  46.39 
 
 		 332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4829  HTH-type transcriptional regulator IdnR  45.78 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4866  HTH-type transcriptional regulator IdnR  45.48 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0303981  normal  0.118687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4885  HTH-type transcriptional regulator IdnR  45.48 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4736  HTH-type transcriptional regulator IdnR  45.48 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4766  HTH-type transcriptional regulator IdnR  45.48 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3289  LacI family transcription regulator  45.02 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1473  L-idonate regulatory protein  44.71 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1578  LacI family transcription regulator  44.41 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1796  L-idonate regulatory protein  44.11 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.248054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  41.93 
 
 		 335 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  40.06 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  39.69 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  39.38 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  38.07 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  36.62 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.73 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  37.15 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4217  LacI family transcription regulator  37.18 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 348 aa  202  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 		 357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2432  alanine racemase  37.39 
 
 		 365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 342 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  36.22 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  37.38 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.67 
 
 		 364 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  37.38 
 
 		 339 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  37.38 
 
 		 339 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  37.38 
 
 		 339 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  37.38 
 
 		 339 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  36.75 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  36.59 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2627  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4322  regulatory protein LacI  36.42 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  33.74 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  36.26 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.26 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  36.88 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  36.95 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  36.92 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  34.98 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  35.38 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  34.06 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  31.53 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 351 aa  178  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  35.56 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  35.49 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  35.38 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  34.09 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>