More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2486 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  99.71 
 
 		 339 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  100 
 
 		 339 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  100 
 
 		 339 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  100 
 
 		 339 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  100 
 
 		 339 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  92.04 
 
 		 339 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  44.41 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1549  LacI family transcription regulator  40.99 
 
 		 344 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1441  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  40.99 
 
 		 344 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0341  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  40.99 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000954655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  37.24 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  38.58 
 
 		 364 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  39.24 
 
 		 350 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  39.41 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  36.95 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03289  DNA-binding transcriptional repressor  37.38 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58674  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0277  transcriptional regulator, LacI family  37.38 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03242  hypothetical protein  37.38 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0275  LacI family transcription regulator  37.38 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3721  transcriptional regulator GntR  37.38 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3916  transcriptional regulator GntR  37.38 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3637  transcriptional regulator GntR  37.38 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.4011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  35.2 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4754  transcriptional regulator GntR  37.38 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  0.56413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  34.67 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  35.96 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  35.96 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  35.96 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  35.96 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  34.77 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.41 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.39 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.41 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  34.81 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.08 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  36.72 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  36.89 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3846  LacI family transcription regulator  35.41 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.58256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 358 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3887  transcriptional regulator GntR  37.05 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.917032  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  34.45 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0265  transcriptional regulator, LacI family  37.18 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.01376  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  32.72 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3547  transcriptional regulator, LacI family  35.37 
 
 		 396 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0134  LacI family transcription regulator  35.15 
 
 		 312 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  33.85 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  35.53 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  31.79 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 335 aa  188  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  35.42 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0224  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 		 332 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  37.38 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4866  HTH-type transcriptional regulator IdnR  28.75 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0303981  normal  0.118687 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  31.76 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4829  HTH-type transcriptional regulator IdnR  28.43 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4766  HTH-type transcriptional regulator IdnR  28.43 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  34.97 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4885  HTH-type transcriptional regulator IdnR  28.43 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4736  HTH-type transcriptional regulator IdnR  28.43 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  31.82 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4520  transcriptional regulator IdnR  28.43 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000192749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04130  DNA-binding transcriptional repressor, 5-gluconate-binding  28.43 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.845114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3733  transcriptional regulator, LacI family  28.43 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  30.98 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.67 
 
 		 382 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4745  transcriptional regulator IdnR  28.43 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  34.18 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  33.01 
 
 		 388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  33.88 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  33.85 
 
 		 348 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0872  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  32.61 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  35.16 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  37.93 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  33.11 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  32.04 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1347  LacI family transcription regulator  30.49 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2432  alanine racemase  35.35 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4217  LacI family transcription regulator  34.49 
 
 		 335 aa  166  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>