More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0968 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 347 aa  668    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  68.98 
 
 		 347 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  66.87 
 
 		 332 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  65.66 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  64.55 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  55.65 
 
 		 350 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  53.47 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  53.94 
 
 		 331 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  55.02 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 351 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 351 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  48.52 
 
 		 351 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 351 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  51.36 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 340 aa  315  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  49.54 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  48.02 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  50.46 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  49.28 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  40.71 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  37.64 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  38.02 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  38.89 
 
 		 342 aa  222  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  39.2 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3831  LacI family transcription regulator  41.74 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167541  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  38.78 
 
 		 336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  39.13 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  42.33 
 
 		 388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  40.23 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 345 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  38.24 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.82 
 
 		 339 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  40.23 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  41.91 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  39.3 
 
 		 343 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.58 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  39 
 
 		 354 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  36.23 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  39.67 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  37.76 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  38.64 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  39.53 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  39.23 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  42.6 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  39.02 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1589  alanine racemase  43.86 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000384981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.95 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.16 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  37.06 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1692  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2346  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  38.72 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2627  LacI family transcription regulator  39.33 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2432  alanine racemase  39.29 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  36.5 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  31.48 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  32.33 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4590  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  35.86 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  31.09 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  35.86 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  30.06 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  33.64 
 
 		 332 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  32.31 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  37.38 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  37.38 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  37.38 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  37.38 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  37.38 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  29.01 
 
 		 333 aa  176  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  31.17 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.33 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0328  LacI family transcription regulator  37.83 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.48 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 342 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1978  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.51 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  36.76 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>