More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0778 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0778  LacI family transcriptional regulator  100 
 
 		 337 aa  678    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.602381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1526  transcriptional regulator, LacI family  68.37 
 
 		 344 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.114079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0580  LacI family transcription regulator  50.15 
 
 		 330 aa  338  7e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2920  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.31 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3225  hypothetical protein  44.24 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3423  extracellular solute-binding protein family 1  44.24 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0782  regulatory protein, LacI  36.83 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1587  regulatory protein LacI  35.71 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000010083  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1261  LacI family transcription regulator  31.52 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  30.45 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1245  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  29.62 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1186  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.3 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0999  LacI family transcription regulator  29.3 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  29.3 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.3 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1164  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4188  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1118  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  28.88 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3965  LacI family transcription regulator  30.42 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4341  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0911  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.24 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107654  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4113  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.12 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3954  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.647552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4230  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4433  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.12 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4286  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.12 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0837  alanine racemase  28.66 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.03 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  29.12 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.24 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.56 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4322  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  31.05 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.12 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4066  LacI family transcription regulator  30.13 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.54 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.68 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  27.89 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  27.89 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  30.81 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  30.81 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.79 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.79 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0627  transcriptional regulator, LacI family  29.31 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.958953 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  29.88 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.79 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.79 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.79 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  29.79 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.79 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0417  LacI family transcription regulator  29.13 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.12 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  26.5 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.04 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0513  transcriptional regulator, LacI family  27.56 
 
 		 325 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  27.3 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.59 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.63 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  29.74 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.74 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  31.05 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.1 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.42 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  29.74 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.77 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1286  LacI family transcription regulator  26.76 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000013505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.88 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.99 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.99 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>