279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0698 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 342 aa  692    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  37.9 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  36.44 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  34.6 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  34.66 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  32.96 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  33.99 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  33.24 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  32.56 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  33.14 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  32.57 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  31.23 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  32.28 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  31.99 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  30.9 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  33.04 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  32.65 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  29.94 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  29.81 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  31.5 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  33.11 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  30.85 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  31.19 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  30.29 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  31.51 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  30.19 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 353 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  27.94 
 
 		 357 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  30.32 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  30.32 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  29.68 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  30.14 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  33.5 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  27.53 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  28.38 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  33.54 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  30.28 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  30.4 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  27.8 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  28.17 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  27.91 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  29.1 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  30.84 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  25.87 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  28.71 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  28.1 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  27.83 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  28.64 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  24.79 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  24.49 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  27.1 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  24.64 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  34.02 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  32.18 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  32.57 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  28.19 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5857  transcriptional regulator, LacI family  40.74 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.55822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.86 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  28.86 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  26.48 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  28.86 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  28.86 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  27.63 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3351  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  decreased coverage  0.0034898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  24.6 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  43.94 
 
 		 340 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.3 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.14 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4670  transcriptional regulator, LacI family  30.26 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  42.42 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1608  HTH-type transcriptional regulator GalR  38.46 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.656083  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2793  transcriptional regulator, LacI family  59.52 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1014  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.91 
 
 		 246 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  43.94 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.45 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  30.71 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1131  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5892  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  19.93 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4188  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1118  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>