More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2793 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2793  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 321 aa  645    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0629  LacI family transcriptional regulator  66.77 
 
 		 326 aa  431  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0752  LacI family transcription regulator  46.54 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.477484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.83 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2808  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0294888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.76 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.48 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.21 
 
 		 339 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0026  regulatory protein LacI  33.54 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.3 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.82 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  30.27 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  31.93 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.55 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.02 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  33.23 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.66 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.66 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3082  alanine racemase  30.18 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.66 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.33 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.33 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 340 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 337 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  30.4 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  33.03 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  33.03 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.03 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.03 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  36.84 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 339 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  27.64 
 
 		 344 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.43 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  35.41 
 
 		 384 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  33.04 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  31.91 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  38.02 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.44 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.21 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 		 346 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3843  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00298813  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.91 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.43 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  34.34 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  36.53 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.82 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.29 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.23 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.21 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  32.05 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  28.97 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  30.92 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.96 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.21 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 344 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  30.43 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>