138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3966 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  100 
 
 		 336 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  86.87 
 
 		 336 aa  597  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  56.08 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  55.22 
 
 		 343 aa  358  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  55 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  52.49 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  45.07 
 
 		 340 aa  281  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  49.85 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  48.24 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  51.16 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  50.3 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  42.06 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  32.44 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  31.9 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  31.72 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 357 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  32.95 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  32.86 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  29.49 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  29.78 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  32.39 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  31.56 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  28.06 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  29.08 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  29.93 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  30.68 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  29.6 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  29.05 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  31.76 
 
 		 346 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  25.28 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  26.82 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  27.64 
 
 		 352 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  27.98 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  28.94 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  26.76 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  26.57 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  28.25 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  27.45 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  26.71 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  26.42 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  24.43 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  27.42 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  26.92 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.16 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.16 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  24.75 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  24.35 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  26.48 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.42 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.88 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.87 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.13 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0973  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.88 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000623082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  24.32 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1480  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.83 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  25.26 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  19.48 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.66 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.55 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.56 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.78 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.48 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3422  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.13 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  25.91 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  29.92 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3687  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.13 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.743219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  22.26 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0776  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.44 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  21.11 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1329  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  20.79 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2073  transcriptional regulator, LacI family  29.18 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000787477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1882  LacI family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.711539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  23.87 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  29.14 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2717  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  22.71 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3351  LacI family transcription regulator  31.08 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  decreased coverage  0.0034898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  25.91 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4006  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  30.56 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  25.91 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  25.91 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1187  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  21.74 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>