186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2053 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 345 aa  710    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  37.71 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  38.27 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  32.17 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  32.19 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  32.3 
 
 		 348 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  36.65 
 
 		 350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  37.42 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  33.22 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  30.52 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 		 351 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  30.29 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  27.75 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  31.76 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  29.97 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  27.35 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  28.82 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  33.01 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  28.81 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  30.48 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  28.01 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  28.86 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  28.45 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  27.39 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  30.04 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  28.76 
 
 		 354 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  27.33 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  27.71 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  27.39 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  29.18 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  28.34 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  27.8 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  27.8 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  27.46 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  27.24 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  26.87 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  28.16 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  31.12 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  25.22 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  24.52 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  24.75 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  26.62 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  25.91 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  23.61 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  24.37 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  29.23 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.22 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  24.43 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0612  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.27 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.52 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144836  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.15 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.15 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.75 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2882  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.41 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.79248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3419  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.49 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2854  putative secreted solute-binding lipoprotein  25.9 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2263  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.77 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1126  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.32 
 
 		 316 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1606  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.32 
 
 		 316 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.099451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1583  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.32 
 
 		 316 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0401008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3102  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.27 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.07 
 
 		 338 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0292  monosaccharide-transporting ATPase  24.87 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4745  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.92 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193376  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  35.23 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.53 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.33 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.94 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.35 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  28.65 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0436  catabolite control protein A  23.55 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000109706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  24.91 
 
 		 345 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3044  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose- binding protein  26.59 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00338498  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1997  ABC ribose transporter, periplasmic ligand binding protein  21.77 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0573  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  30.77 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1631  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.32 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.817449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 		 320 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2019  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  24.78 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  26.37 
 
 		 326 aa  49.3  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39350  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  22.07 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1853  putative ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  24.78 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1187  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  25 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1503  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.8 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1866  putative ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  24.78 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  23.4 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11060  monosaccharide-binding protein  25.74 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>