More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4733 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 341 aa  671    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2555  transcriptional regulator, LacI family  58.68 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679604  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2322  transcriptional regulator, LacI family  56.18 
 
 		 357 aa  338  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131448  normal  0.0414369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  41.19 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0809  transcriptional regulator, LacI family  40.88 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4547  transcriptional regulator, LacI family  40.64 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  39.22 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1554  LacI family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4528  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6174  transcriptional regulator, LacI-family  33.33 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3841  regulatory protein LacI  36.39 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4014  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.24 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0637146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3954  regulatory protein LacI  32.24 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3845  transcriptional regulator, LacI-family  32.24 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587178  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0673  regulatory protein, LacI  38.14 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.371597  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3910  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.24 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3832  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.83 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0370934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  32.77 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  32.29 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  32.17 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  32.57 
 
 		 343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  32.66 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  32.28 
 
 		 353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.75 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.59 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  27.06 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  32.39 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  29.59 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.59 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.38 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  30.42 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  28.98 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.3 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  29.51 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  25.81 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0372  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  25.15 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  32.01 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.56 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  32.28 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  28.81 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  30.06 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  30.29 
 
 		 358 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  32.64 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  26.93 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  32.08 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  32.31 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 331 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  26.92 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  31.69 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  29.6 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  26.98 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  25.36 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  24.2 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3434  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873255  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  28.82 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.29 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4409  transcriptional regulator, LacI family  31.99 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  32.66 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  29.71 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  27.49 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4672  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.89 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  32.32 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>