More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3233 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3233  trehalose repressor  100 
 
 		 318 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0123799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004236  trehalose operon transcriptional repressor  60.45 
 
 		 315 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0576  trehalose repressor  60.97 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01204  trehalose repressor  58.2 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0431  trehalose repressor  58.52 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.628925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0534  trehalose repressor  47.08 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0496  trehalose repressor  46.77 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1162  trehalose repressor  46.77 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0432  trehalose repressor  46.77 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4708  trehalose repressor  43.52 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00969593  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4858  trehalose repressor  43.52 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0591749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4803  trehalose repressor  43.52 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.94717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4837  trehalose repressor  43.52 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4813  trehalose repressor  43.71 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4495  trehalose repressor  43.71 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04109  trehalose repressor  43.71 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3770  trehalose repressor  43.71 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4722  trehalose repressor  43.71 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.557711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04073  hypothetical protein  43.71 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5763  trehalose repressor  43.71 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.693149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0440  trehalose repressor  41.59 
 
 		 315 aa  255  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3753  transcriptional regulator, LacI family  43.71 
 
 		 315 aa  254  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4842  trehalose repressor  43.57 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4739  trehalose repressor  43.19 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0770  trehalose repressor  43.2 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2419  transcriptional regulator, LacI family  39.02 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0973  sucrose operon repressor ScrR  30.92 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0805141  normal  0.0172399 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000600  sucrose operon repressor ScrR LacI family  27.87 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0144892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3434  LacI family transcription regulator  29.78 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873255  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0598  putative sucrose operon repressor ScrR  26.75 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00468324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1512  sucrose operon repressor  27.74 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00522877  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  27.38 
 
 		 337 aa  108  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  28.4 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1784  sucrose operon repressor  27.15 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000176161  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  26.52 
 
 		 344 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2649  LacI family transcription regulator  28.37 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.53 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0811  sucrose operon repressor  28.34 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1497  sucrose operon repressor  25.4 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0669  LacI family sucrose operon repressor  28.85 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2335  LacI family transcription regulator  28.37 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0719  sucrose operon repressor  28.85 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3656  transcriptional regulator, LacI family  28.27 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0755  sucrose operon repressor  28.85 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.75 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0918  sucrose operon repressor  28.34 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  26.23 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  25.89 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  26.02 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  25.9 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  25.9 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3846  LacI family transcription regulator  26.18 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.58256 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  27.63 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.49 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  26.38 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  28.63 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  27.3 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  25.57 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03289  DNA-binding transcriptional repressor  26.58 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03242  hypothetical protein  26.58 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  25.57 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  26.77 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  26.18 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  25.9 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.69 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  26.18 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  25.9 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.53 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  26.18 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3916  transcriptional regulator GntR  26.58 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  26.18 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  26.18 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  26.43 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0277  transcriptional regulator, LacI family  26.58 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  25.57 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3637  transcriptional regulator GntR  26.58 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.4011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  26.52 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  26.52 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3721  transcriptional regulator GntR  26.58 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0275  LacI family transcription regulator  26.58 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.52 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  26.06 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  25.4 
 
 		 334 aa  96.3  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  27.01 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2115  sucrose operon repressor  25.89 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2079  sucrose operon repressor  25.89 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.321013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.9 
 
 		 337 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4754  transcriptional regulator GntR  26.27 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  0.56413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5093  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  25.63 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0265  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.01376  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  25.16 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.65 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  25.24 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  28.31 
 
 		 349 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  24.84 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  26.37 
 
 		 355 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  26.56 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>