More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1162 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0496  trehalose repressor  100 
 
 		 317 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1162  trehalose repressor  100 
 
 		 317 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0432  trehalose repressor  100 
 
 		 317 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0534  trehalose repressor  79.75 
 
 		 315 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04109  trehalose repressor  62.03 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3770  trehalose repressor  62.03 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5763  trehalose repressor  62.03 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.693149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04073  hypothetical protein  62.03 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4722  trehalose repressor  62.03 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.557711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4813  trehalose repressor  62.03 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4495  trehalose repressor  62.03 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3753  transcriptional regulator, LacI family  62.03 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4803  trehalose repressor  60.76 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.94717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4858  trehalose repressor  60.76 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0591749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4837  trehalose repressor  60.76 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4842  trehalose repressor  62.03 
 
 		 321 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4708  trehalose repressor  60.76 
 
 		 315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00969593  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4739  trehalose repressor  60.44 
 
 		 315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0440  trehalose repressor  60.44 
 
 		 315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004236  trehalose operon transcriptional repressor  49.84 
 
 		 315 aa  315  9e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01204  trehalose repressor  49.84 
 
 		 315 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0770  trehalose repressor  49.68 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0576  trehalose repressor  48.71 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0431  trehalose repressor  49.34 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.628925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3233  trehalose repressor  46.77 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0123799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2419  transcriptional regulator, LacI family  38.78 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961988  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1512  sucrose operon repressor  26.48 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00522877  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0973  sucrose operon repressor ScrR  31.07 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0805141  normal  0.0172399 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000600  sucrose operon repressor ScrR LacI family  27.69 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0144892  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1497  sucrose operon repressor  25.71 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0598  putative sucrose operon repressor ScrR  29.19 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00468324  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  27.46 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1784  sucrose operon repressor  25.64 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000176161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3434  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873255  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2079  sucrose operon repressor  26.01 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.321013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2115  sucrose operon repressor  26.01 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0669  LacI family sucrose operon repressor  28.57 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0811  sucrose operon repressor  27.48 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0918  sucrose operon repressor  29.19 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  26.92 
 
 		 386 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0719  sucrose operon repressor  27.95 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0755  sucrose operon repressor  27.95 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.57 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0252  transcriptional regulator, LacI family  26.77 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.65 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.48 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  27.1 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  26.73 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.48 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0111  transcriptional regulator, LacI family  26.42 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000119468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  26.03 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  26.77 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  26.77 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  28.44 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  26.77 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  25.97 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  27.58 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  26.45 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  27.7 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  26.77 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  26.77 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  26.99 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  27.03 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.87 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  27.66 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.81 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3082  alanine racemase  26.23 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  26.45 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  28.1 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  26.45 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  28.7 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.45 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  29.01 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  28.77 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  26.75 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  27.05 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.15 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1500  LacI family transcription regulator  27.42 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  26.23 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  29.13 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  29.18 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  27.64 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  27.46 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  25.61 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  26.23 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.48 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  25.31 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  26.23 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  26.23 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  27.51 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  25.62 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.54 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>