More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004236 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004236  trehalose operon transcriptional repressor  100 
 
 		 315 aa  651    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01204  trehalose repressor  92.01 
 
 		 315 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0431  trehalose repressor  70.57 
 
 		 316 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.628925  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0576  trehalose repressor  70.32 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3233  trehalose repressor  60.45 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0123799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0534  trehalose repressor  51.8 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0432  trehalose repressor  49.84 
 
 		 317 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0496  trehalose repressor  49.84 
 
 		 317 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1162  trehalose repressor  49.84 
 
 		 317 aa  315  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4708  trehalose repressor  46.51 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00969593  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4858  trehalose repressor  46.51 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0591749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4837  trehalose repressor  46.51 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4803  trehalose repressor  46.51 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.94717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4495  trehalose repressor  46.71 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4813  trehalose repressor  46.71 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04109  trehalose repressor  46.71 
 
 		 315 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04073  hypothetical protein  46.71 
 
 		 315 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4722  trehalose repressor  46.71 
 
 		 315 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.557711 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3770  trehalose repressor  46.71 
 
 		 315 aa  286  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5763  trehalose repressor  46.71 
 
 		 315 aa  285  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.693149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4739  trehalose repressor  46.18 
 
 		 315 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3753  transcriptional regulator, LacI family  46.71 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4842  trehalose repressor  46.38 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0440  trehalose repressor  46.05 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0770  trehalose repressor  45.33 
 
 		 313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2419  transcriptional regulator, LacI family  38.91 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961988  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1512  sucrose operon repressor  29.9 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00522877  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000600  sucrose operon repressor ScrR LacI family  29.18 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0144892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1784  sucrose operon repressor  28.81 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000176161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0973  sucrose operon repressor ScrR  30.65 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0805141  normal  0.0172399 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0598  putative sucrose operon repressor ScrR  29.97 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00468324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0719  sucrose operon repressor  29.53 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0669  LacI family sucrose operon repressor  29.53 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0918  sucrose operon repressor  29.53 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0755  sucrose operon repressor  29.53 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.62 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1497  sucrose operon repressor  28.21 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  31.85 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0811  sucrose operon repressor  28.76 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.15 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  28.75 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  28.09 
 
 		 386 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  27.54 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  27.51 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3656  transcriptional regulator, LacI family  29.21 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.17 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  28.17 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3082  alanine racemase  27.88 
 
 		 363 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3434  LacI family transcription regulator  27.56 
 
 		 356 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873255  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.98 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  29.25 
 
 		 344 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 		 340 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  31.5 
 
 		 351 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.66 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  29.03 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  26.58 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  27.83 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  24.68 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0252  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  28.67 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2649  LacI family transcription regulator  25.94 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.13 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  29.3 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  28.41 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  28.41 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  29.3 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  29.3 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2335  LacI family transcription regulator  25.94 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.31 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  28.41 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.41 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0194  LacI family transcription regulator  24.68 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.41 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  27.57 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.41 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.39 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  28.3 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.41 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.41 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.45 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  29.94 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  27.57 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  27.53 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.62 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  27.53 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.87 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.41 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  27.53 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  28.98 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.19 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>