More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01204 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01204  trehalose repressor  100 
 
 		 315 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004236  trehalose operon transcriptional repressor  92.01 
 
 		 315 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0431  trehalose repressor  70.38 
 
 		 316 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.628925  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0576  trehalose repressor  68.06 
 
 		 314 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3233  trehalose repressor  58.2 
 
 		 318 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0123799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0534  trehalose repressor  51.48 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0496  trehalose repressor  49.84 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0432  trehalose repressor  49.84 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1162  trehalose repressor  49.84 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4708  trehalose repressor  46.84 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00969593  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4858  trehalose repressor  46.84 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0591749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4803  trehalose repressor  46.84 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.94717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4837  trehalose repressor  46.84 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4739  trehalose repressor  46.51 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04109  trehalose repressor  47.18 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4813  trehalose repressor  47.18 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4495  trehalose repressor  47.18 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04073  hypothetical protein  47.18 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3770  trehalose repressor  47.18 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4722  trehalose repressor  47.18 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.557711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5763  trehalose repressor  47.18 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.693149  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3753  transcriptional regulator, LacI family  47.18 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4842  trehalose repressor  46.84 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0440  trehalose repressor  46.51 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0770  trehalose repressor  45.03 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2419  transcriptional regulator, LacI family  39.25 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961988  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1512  sucrose operon repressor  29.26 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00522877  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000600  sucrose operon repressor ScrR LacI family  29.51 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0144892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1784  sucrose operon repressor  28.62 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000176161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0973  sucrose operon repressor ScrR  30.65 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0805141  normal  0.0172399 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0598  putative sucrose operon repressor ScrR  29.97 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00468324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  27.24 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0719  sucrose operon repressor  29.33 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0669  LacI family sucrose operon repressor  29.33 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0918  sucrose operon repressor  29.33 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0755  sucrose operon repressor  29.33 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  27.96 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0811  sucrose operon repressor  28.67 
 
 		 328 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1497  sucrose operon repressor  26.8 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  30.74 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3656  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3082  alanine racemase  30 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  27.21 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  26.97 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.32 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.16 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.88 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.23 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  27.85 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  27.74 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3434  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873255  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  25.16 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  27.83 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  28.03 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  27.83 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  27.22 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  28.8 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  31.37 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.63 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  27.51 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.51 
 
 		 352 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  31.13 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  27.51 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0252  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  24.68 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  27.24 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  26.88 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  27.18 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  28.96 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  25.9 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2649  LacI family transcription regulator  25.6 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2335  LacI family transcription regulator  25.6 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  27.48 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  27.18 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.8 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  27.18 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.27 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.8 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  27.83 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  27.18 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  27.18 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  27.18 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  27.51 
 
 		 352 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 326 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 357 aa  99.4  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  26.84 
 
 		 341 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  24.03 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  26.52 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>