More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0440 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0440  trehalose repressor  100 
 
 		 315 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04109  trehalose repressor  87.94 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4495  trehalose repressor  87.94 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5763  trehalose repressor  87.94 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.693149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3770  trehalose repressor  87.94 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04073  hypothetical protein  87.94 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4722  trehalose repressor  87.94 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.557711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4813  trehalose repressor  87.94 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4842  trehalose repressor  87.3 
 
 		 321 aa  577  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3753  transcriptional regulator, LacI family  87.62 
 
 		 315 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4708  trehalose repressor  85.71 
 
 		 315 aa  570  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00969593  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4803  trehalose repressor  86.03 
 
 		 315 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.94717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4858  trehalose repressor  86.03 
 
 		 315 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0591749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4837  trehalose repressor  86.03 
 
 		 315 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4739  trehalose repressor  85.71 
 
 		 315 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0534  trehalose repressor  62.54 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1162  trehalose repressor  60.44 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0432  trehalose repressor  60.44 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0496  trehalose repressor  60.44 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0770  trehalose repressor  46.6 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0431  trehalose repressor  50.5 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.628925  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0576  trehalose repressor  46.51 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004236  trehalose operon transcriptional repressor  46.05 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01204  trehalose repressor  46.51 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3233  trehalose repressor  41.59 
 
 		 318 aa  255  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0123799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2419  transcriptional regulator, LacI family  36.59 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961988  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1512  sucrose operon repressor  27.53 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00522877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3434  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873255  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  28.82 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000600  sucrose operon repressor ScrR LacI family  27.42 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0144892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0973  sucrose operon repressor ScrR  27.85 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0805141  normal  0.0172399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1784  sucrose operon repressor  26.95 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000176161  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0598  putative sucrose operon repressor ScrR  28.53 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00468324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0669  LacI family sucrose operon repressor  25.08 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1497  sucrose operon repressor  24.68 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0811  sucrose operon repressor  24.27 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0719  sucrose operon repressor  25.08 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0918  sucrose operon repressor  25.08 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0755  sucrose operon repressor  25.08 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1077  LacI family transcription regulator  25.98 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2079  sucrose operon repressor  24.29 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.321013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2115  sucrose operon repressor  24.29 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  26.99 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0111  transcriptional regulator, LacI family  26.17 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000119468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  26.54 
 
 		 332 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.79 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  26.54 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  26.6 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  26.98 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  25.55 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  25.23 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  29.46 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  24.69 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.27 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0252  transcriptional regulator, LacI family  26.89 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.63 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  24.76 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  26.02 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1347  LacI family transcription regulator  26.05 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  27.38 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  24.52 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  24.6 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  24.6 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  24.6 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  27.55 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  26.99 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  25.47 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  25.76 
 
 		 347 aa  99.4  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0233  regulatory protein LacI  27.3 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  24.6 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  26.03 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  24.6 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  24.84 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  26.85 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  23.96 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.16 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3656  transcriptional regulator, LacI family  22.15 
 
 		 330 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  24.2 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  30.69 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  24.28 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  25.16 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  24.84 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  26.4 
 
 		 349 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  26.56 
 
 		 333 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2876  transcriptional regulator, LacI family  28.35 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.900808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4767  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  27.62 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 349 aa  95.9  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27.46 
 
 		 340 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  28.16 
 
 		 339 aa  95.9  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  28.71 
 
 		 340 aa  95.5  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  25.6 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  27.62 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  27.62 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  27.62 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  27.62 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  23.58 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>