More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0905 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 340 aa  706    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  77.64 
 
 		 332 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03620  hypothetical protein  76.13 
 
 		 332 aa  531  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  48.65 
 
 		 327 aa  305  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  47.27 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  47.27 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  47.27 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 		 338 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  37.73 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.66 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  36.14 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  38.37 
 
 		 336 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  39.66 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 		 344 aa  225  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  35.14 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.43 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  36.2 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3832  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.24 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  38.8 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.45 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.83 
 
 		 342 aa  222  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  40 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  36.25 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  36.83 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  34.43 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3180  HTH-type transcriptional regulator AscG  34.43 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3228  HTH-type transcriptional regulator AscG  34.43 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  34.43 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.59 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  34.43 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  35.83 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.88 
 
 		 343 aa  215  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02685  DNA-binding transcriptional repressor  37.88 
 
 		 343 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02646  hypothetical protein  37.88 
 
 		 343 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0878  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.88 
 
 		 343 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3157  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.88 
 
 		 343 aa  215  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2984  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.88 
 
 		 343 aa  215  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0853  transcriptional regulator, LacI family  37.88 
 
 		 343 aa  215  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2985  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.88 
 
 		 343 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  36.77 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4106  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.88 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  hitchhiker  0.000026097 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1562  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.85 
 
 		 345 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1823  transcriptional regulator, LacI family  38.06 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 335 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  35.81 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  36.79 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.58 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.58 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.58 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3160  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.97 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706978  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3241  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.97 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3226  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.97 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639669 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3178  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.97 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  32.07 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.07 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.07 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.07 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3342  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.97 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0205886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  33.33 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  32.07 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.07 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03325  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.43 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3278  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.28 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2446  DNA-binding transcriptional regulator GalS  31.78 
 
 		 346 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  33.53 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02564  DNA-binding transcriptional repressor  33.33 
 
 		 337 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2426  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.26 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.656004  normal  0.991172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2540  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.26 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  0.113132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2850  transcriptional regulator AscG  33.33 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2382  DNA-binding transcriptional regulator GalS  31.96 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.824252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2337  DNA-binding transcriptional regulator GalS  31.96 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2430  DNA-binding transcriptional regulator GalS  31.67 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.688486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3162  transcriptional regulator AscG  33.33 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3965  transcriptional regulator AscG  33.04 
 
 		 350 aa  202  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 342 aa  202  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0975  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2999  transcriptional regulator AscG  33.04 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0998  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1608  HTH-type transcriptional regulator GalR  35.74 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.656083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0552  transcriptional regulator for galactose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.58 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  31.96 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2838  transcriptional regulator AscG  32.74 
 
 		 350 aa  198  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  35.29 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1669  HTH-type transcriptional regulator GalR  34.97 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  35.29 
 
 		 335 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  34.74 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  34.97 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3616  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.427646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>