More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2079 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2079  sucrose operon repressor  100 
 
 
316 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.321013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2115  sucrose operon repressor  100 
 
 
316 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1497  sucrose operon repressor  63.92 
 
 
317 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0669  LacI family sucrose operon repressor  39.48 
 
 
328 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0719  sucrose operon repressor  39.87 
 
 
328 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0755  sucrose operon repressor  39.87 
 
 
328 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0918  sucrose operon repressor  39.87 
 
 
328 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0811  sucrose operon repressor  38.83 
 
 
328 aa  222  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0252  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 
332 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1512  sucrose operon repressor  34.95 
 
 
325 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00522877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1784  sucrose operon repressor  33.92 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000176161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0111  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 
322 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000119468  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0287  LacI family transcription regulator  30.93 
 
 
321 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.348286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  31.39 
 
 
336 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3434  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 
356 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873255  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000600  sucrose operon repressor ScrR LacI family  30.54 
 
 
328 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0144892  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  28.05 
 
 
344 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0973  sucrose operon repressor ScrR  32.32 
 
 
337 aa  142  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0805141  normal  0.0172399 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0598  putative sucrose operon repressor ScrR  30.03 
 
 
330 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00468324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0534  trehalose repressor  27.81 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3656  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2419  transcriptional regulator, LacI family  26.51 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4858  trehalose repressor  28.1 
 
 
315 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0591749  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4837  trehalose repressor  28.1 
 
 
315 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4803  trehalose repressor  28.1 
 
 
315 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.94717  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1162  trehalose repressor  26.01 
 
 
317 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.949155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4708  trehalose repressor  28.1 
 
 
315 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00969593  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0496  trehalose repressor  26.01 
 
 
317 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0432  trehalose repressor  26.01 
 
 
317 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4739  trehalose repressor  28.1 
 
 
315 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  28.52 
 
 
323 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  28.52 
 
 
323 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  28.52 
 
 
323 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5763  trehalose repressor  26.73 
 
 
315 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.693149  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  28.81 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4813  trehalose repressor  27.04 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4495  trehalose repressor  27.04 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  27.54 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4842  trehalose repressor  27.04 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04109  trehalose repressor  27.04 
 
 
315 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  27.54 
 
 
323 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4722  trehalose repressor  27.04 
 
 
315 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.557711 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3770  trehalose repressor  27.04 
 
 
315 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  27.54 
 
 
323 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.53 
 
 
323 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04073  hypothetical protein  27.04 
 
 
315 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  28.19 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3753  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  27.21 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  25.32 
 
 
386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  27.85 
 
 
323 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1423  transcriptional regulator, LacI family  26.52 
 
 
340 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.189138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  29.35 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  28.39 
 
 
331 aa  113  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0440  trehalose repressor  24.29 
 
 
315 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  26.32 
 
 
328 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.43 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.7 
 
 
328 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.39 
 
 
341 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  25.5 
 
 
329 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.18 
 
 
342 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  26.75 
 
 
340 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  27.93 
 
 
343 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0576  trehalose repressor  27.63 
 
 
314 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  26.76 
 
 
334 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.36 
 
 
337 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  28.16 
 
 
332 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  28.16 
 
 
332 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  25.97 
 
 
358 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  26.23 
 
 
344 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.04 
 
 
336 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  27.39 
 
 
334 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.87 
 
 
327 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0896  LacI family transcription regulator  26.38 
 
 
335 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4307  transcriptional regulator, LacI family  25.87 
 
 
343 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.19442  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.71 
 
 
342 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  26.43 
 
 
334 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0431  trehalose repressor  26.38 
 
 
316 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.628925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  27.83 
 
 
332 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  27.83 
 
 
332 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  26.43 
 
 
333 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  26.43 
 
 
333 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  26.43 
 
 
333 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  26.43 
 
 
333 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  26.48 
 
 
331 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  26.49 
 
 
337 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.42 
 
 
325 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.27 
 
 
330 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  26.43 
 
 
333 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  26.25 
 
 
344 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  23.25 
 
 
343 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  25.24 
 
 
332 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  26.93 
 
 
340 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0119  ribose operon repressor RbsR  27.21 
 
 
328 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  27.83 
 
 
332 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  26.01 
 
 
337 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.07 
 
 
334 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>