More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0252 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0252  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 332 aa  669    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0811  sucrose operon repressor  39.44 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0669  LacI family sucrose operon repressor  38.51 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0918  sucrose operon repressor  38.51 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0719  sucrose operon repressor  38.51 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0755  sucrose operon repressor  38.51 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1512  sucrose operon repressor  40.62 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00522877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1784  sucrose operon repressor  39.87 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000176161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2079  sucrose operon repressor  37.09 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.321013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2115  sucrose operon repressor  37.09 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1497  sucrose operon repressor  38.06 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0111  transcriptional regulator, LacI family  35.79 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000119468  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  30.46 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3434  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873255  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0287  LacI family transcription regulator  35.15 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.348286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3656  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000600  sucrose operon repressor ScrR LacI family  32.11 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0144892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.52 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0598  putative sucrose operon repressor ScrR  32.24 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00468324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0973  sucrose operon repressor ScrR  32.11 
 
 		 337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0805141  normal  0.0172399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  32.03 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.73 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  28.1 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.69 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  30.58 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.57 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.18 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.96 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  27.96 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1162  trehalose repressor  26.77 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949155 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0496  trehalose repressor  26.77 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0432  trehalose repressor  26.77 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  27.76 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  31.61 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  29.94 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  32.7 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  27.91 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  29.94 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.14 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  32.08 
 
 		 329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  32.08 
 
 		 329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  29.57 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.48 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.97 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  29.17 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  26.36 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.4 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  29.24 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0534  trehalose repressor  26.03 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.4 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.24 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  29.24 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.24 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  29.24 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  29.24 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4520  transcriptional regulator IdnR  29.64 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000192749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  26.35 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.89 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.67 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  26.35 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  29.24 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  26.35 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  26.35 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.7 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  26.35 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04130  DNA-binding transcriptional repressor, 5-gluconate-binding  29.64 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.845114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  30.15 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3733  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.88 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3846  LacI family transcription regulator  26.65 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.58256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.58 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  28.66 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.48 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.18 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 343 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  29.24 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.48 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4739  trehalose repressor  27.54 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  29.49 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  28.9 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1286  LacI family transcription regulator  27.65 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000013505  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4754  transcriptional regulator GntR  26.51 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  0.56413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4803  trehalose repressor  27.54 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.94717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4858  trehalose repressor  27.54 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0591749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.49 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4837  trehalose repressor  27.54 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.59 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  26.51 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3542  transcriptional regulator, LacI family  29.45 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.59 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  27.39 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>