More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0763 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0763  regulatory protein, LacI  100 
 
 
320 aa  649    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0941  alanine racemase  54.43 
 
 
328 aa  351  8.999999999999999e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393533  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 
344 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 
348 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.07 
 
 
333 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.46 
 
 
331 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 
340 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 
337 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.87 
 
 
341 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.56 
 
 
328 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.87 
 
 
341 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 
355 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.87 
 
 
341 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.04 
 
 
333 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.2 
 
 
333 aa  148  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.79 
 
 
335 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  32.74 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.23 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.76 
 
 
330 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  30.52 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  30.52 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.52 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.52 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.52 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.52 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  30.52 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.52 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  31.64 
 
 
334 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  34.92 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 
329 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  34.31 
 
 
330 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 
336 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.58 
 
 
341 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  34.6 
 
 
332 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  34.6 
 
 
332 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  31.03 
 
 
334 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  34.6 
 
 
332 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  33.97 
 
 
330 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  34.6 
 
 
332 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  34.31 
 
 
330 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
342 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  34.31 
 
 
330 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  33.97 
 
 
330 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  30.38 
 
 
335 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  34.31 
 
 
330 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 
335 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.99 
 
 
330 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.2 
 
 
335 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  30.79 
 
 
338 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 
349 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  31.25 
 
 
334 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.12 
 
 
341 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 
328 aa  142  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  30.94 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.23 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.23 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.23 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.23 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.23 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  32.62 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  30.93 
 
 
361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  30.55 
 
 
341 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 
386 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.49 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  30.96 
 
 
325 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  30.61 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.41 
 
 
337 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  25.52 
 
 
342 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  32.67 
 
 
333 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 
334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  28.08 
 
 
342 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 
337 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.25 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  32.56 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.7 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.5 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 
341 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  31.58 
 
 
331 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  31.41 
 
 
338 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.22 
 
 
349 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  33.23 
 
 
334 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.81 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.58 
 
 
337 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  30.1 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.22 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.74 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  33.86 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  28.39 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.7 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.98 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  32.08 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  28.27 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  30.65 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>