More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0941 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0941  alanine racemase  100 
 
 		 328 aa  674    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393533  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0763  regulatory protein, LacI  54.43 
 
 		 320 aa  351  8.999999999999999e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  36.92 
 
 		 344 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.57 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.4 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 353 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  34.99 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.24 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.44 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  35.61 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  34.49 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  34.1 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.86 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 335 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.6 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.82 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.15 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  32.15 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.24 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.43 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.94 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.05 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  34.07 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  33.65 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.19 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 355 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  33.75 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  33.75 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  32.32 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  31.95 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.17 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  34.38 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.15 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  33.75 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  33.75 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  32.25 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  33.75 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  33.12 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  30.79 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.64 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.15 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  31.98 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  31.36 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  33.44 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.16 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 333 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.78 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.04 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.04 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 339 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  31.95 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  31.18 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.04 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  33.04 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  33.04 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.77 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  31.13 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  33.04 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  32.75 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.96 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  33.23 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  33.02 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  31.67 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.67 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  32.91 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.67 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.67 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  31.67 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.67 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.67 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>