36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51630 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51630  periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 		 355 aa  723    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37920  periplasmic sugar-binding protein  62.69 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04030  periplasmic sugar binding protein  61.66 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0192587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49230  Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  60.06 
 
 		 376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3045  sugar-binding protein, putative  32.7 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1940  sugar-binding protein, putative  33.44 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3533  sugar-binding protein, putative  30.22 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0877  sugar-binding protein, putative  30.63 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3714  sugar-binding protein, putative  30.94 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1611  sugar-binding protein, putative  28.52 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.677108  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4930  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  27.04 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2717  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  27.13 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2945  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  26.42 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3423  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  26.82 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54411  predicted protein  28.36 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0187117  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  29.1 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.25 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0778  ribose ABC transporter periplasmic-binding protein  24.53 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1601  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.03 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.54 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.41 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.41 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.57 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0225  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  22.22 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6155  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  26.47 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  24.16 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5241  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.78 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.635479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.95 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2594  putative periplasmic binding ABC transporter protein  22.34 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.693301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  25.66 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  25.98 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.45 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4599  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  26.61 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  27.83 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1963  sugar ABC transporter substrate-binding protein  26.52 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  36.76 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>