66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49230 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49230  Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 376 aa  761    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37920  periplasmic sugar-binding protein  61.71 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51630  periplasmic sugar-binding protein  60.06 
 
 		 355 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04030  periplasmic sugar binding protein  61.59 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0192587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3533  sugar-binding protein, putative  31.74 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3714  sugar-binding protein, putative  32.56 
 
 		 336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3045  sugar-binding protein, putative  32.87 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0877  sugar-binding protein, putative  31.1 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1940  sugar-binding protein, putative  32.34 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1611  sugar-binding protein, putative  29.81 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.677108  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4930  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  27.08 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2717  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  27.07 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2945  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  27.61 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3423  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  27.11 
 
 		 328 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54411  predicted protein  31.55 
 
 		 626 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0187117  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1601  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.39 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0778  ribose ABC transporter periplasmic-binding protein  24.58 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.55 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5809  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  28.25 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.19 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2594  putative periplasmic binding ABC transporter protein  31.25 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.693301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6266  rhamnose ABC transporter rhamnose-binding protein  28.12 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3570  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  28.39 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0352467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2434  putative periplasmic binding abc transporter protein  28.34 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4070  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  26.9 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0973  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.99 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000623082  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4599  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  30 
 
 		 320 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  26.63 
 
 		 331 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1963  sugar ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0225  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  26.75 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.91 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.91 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6155  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  27.87 
 
 		 317 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1853  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.29 
 
 		 339 aa  49.7  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3087  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.48 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154884  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  30.85 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 		 346 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3346  ribose ABC transporter periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2212  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  24.29 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02650  D-ribose-binding periplasmic protein  21.65 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0711  ABC transporter, solute-binding, sugar transport  21.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2490  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.8 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3653  autoinducer AI-2 ABC transporter, periplasmic AI-2-binding protein  30.07 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.502684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.68 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3110  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.9 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00370209  hitchhiker  0.000114297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0861  autoinducer AI-2 ABC transporter periplasmic AI-2-binding protein  30.07 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3524  autoinducer AI-2 ABC transporter, periplasmic AI-2-binding protein  30.07 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4323  hypothetical protein  31.97 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4293  hypothetical protein  31.97 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4408  hypothetical protein  31.97 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4406  hypothetical protein  31.97 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0278  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.33 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.11019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  34.07 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  28.52 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2973  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  22.65 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1874  ribose ABC transporter periplasmic ribose-binding protein  22.65 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3045  monosaccharide-transporting ATPase  22.65 
 
 		 309 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02611  hypothetical protein  21.25 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2461  rhamnose ABC transporter, rhamnose-binding  23.7 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0293175  normal  0.309769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6707  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.51 
 
 		 315 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2634  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6313  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.51 
 
 		 315 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6472  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.51 
 
 		 315 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 343 aa  43.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>