45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04030 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04030  periplasmic sugar binding protein  100 
 
 		 316 aa  634    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0192587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37920  periplasmic sugar-binding protein  66.01 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51630  periplasmic sugar-binding protein  61.66 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49230  Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  61.59 
 
 		 376 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3045  sugar-binding protein, putative  32.39 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3533  sugar-binding protein, putative  31.46 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0877  sugar-binding protein, putative  32.18 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1940  sugar-binding protein, putative  32.34 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3714  sugar-binding protein, putative  29.87 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4930  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  28.03 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1611  sugar-binding protein, putative  29.96 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.677108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2945  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  26.88 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2717  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  28.62 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3423  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  27.39 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54411  predicted protein  33.52 
 
 		 626 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0187117  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1601  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.57 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.45 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.41 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  36.14 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0778  ribose ABC transporter periplasmic-binding protein  33.9 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6155  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  26.1 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5473  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.93 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433436  normal  0.94425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  27.5 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  23.39 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.26 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0973  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.69 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000623082  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  37.37 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  41.79 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  41.79 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0225  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  24.53 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.51 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  26.54 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4599  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  26.57 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1252  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  19.93 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.09 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5241  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.41 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.635479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3045  monosaccharide-transporting ATPase  22.5 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2973  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  22.5 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1874  ribose ABC transporter periplasmic ribose-binding protein  22.5 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433268 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  23.78 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.38 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.39 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2133  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.56 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7477  sugar ABC transporter  23.42 
 
 		 345 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>