More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0425 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0425  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 328 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4284  LacI family transcription regulator  98.48 
 
 		 328 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0150  LacI family transcription regulator  85.98 
 
 		 328 aa  577  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3019  LacI family transcription regulator  79.26 
 
 		 339 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2882  LacI family transcription regulator  79.57 
 
 		 339 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2967  LacI family transcription regulator  78.95 
 
 		 339 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2358  LacI family transcription regulator  79.26 
 
 		 339 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2972  LacI family transcription regulator  79.26 
 
 		 339 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6321  LacI family transcription regulator  78.64 
 
 		 339 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2992  LacI family transcription regulator  78.95 
 
 		 339 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0300  LacI family transcription regulator  76.47 
 
 		 339 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3388  LacI family transcription regulator  76.42 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0528  LacI family transcription regulator  76.42 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3062  LacI family transcription regulator  76.42 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2031  LacI family transcription regulator  76.42 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0336  LacI family transcription regulator  76.42 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0349  LacI family transcription regulator  76.42 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.912669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2253  LacI family transcription regulator  76.42 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0454  LacI family transcription regulator  58.59 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  54.55 
 
 		 330 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.76 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  32.91 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.94 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  33.55 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  33.62 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  38.95 
 
 		 339 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 		 348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  31.58 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.26 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  34.26 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.26 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.26 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  34.26 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.26 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.78 
 
 		 347 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.26 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.26 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  36.45 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 		 386 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  31.92 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  34.22 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2505  LacI family transcription regulator  28.07 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.95 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 358 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.96 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.06 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.18 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  35.94 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  32.11 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.52 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.02 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  32.41 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.42 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  35.35 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  30.35 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  30.68 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  34.36 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  32.38 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.86 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  34.43 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  34.39 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.27 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  30.35 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  32.56 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  35.13 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  35.13 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  35.13 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>