More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81358 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  100 
 
 
1407 aa  2898    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  39.67 
 
 
1288 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  31.44 
 
 
1325 aa  457  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  31.58 
 
 
811 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  32.44 
 
 
936 aa  404  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  30.91 
 
 
1041 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  34.58 
 
 
790 aa  379  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  34.01 
 
 
1436 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  34.04 
 
 
1581 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 
1450 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  29.38 
 
 
1469 aa  314  7.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  31.3 
 
 
1189 aa  296  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  32.96 
 
 
924 aa  295  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  31.52 
 
 
1261 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  32.73 
 
 
1135 aa  290  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  32.53 
 
 
528 aa  286  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  31.65 
 
 
1325 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.74 
 
 
1298 aa  279  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  30.92 
 
 
783 aa  278  7e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  31.17 
 
 
1324 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  31.52 
 
 
720 aa  276  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  32.47 
 
 
1241 aa  274  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  31.22 
 
 
771 aa  274  8.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  31.96 
 
 
1303 aa  274  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  31.32 
 
 
989 aa  273  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  31.95 
 
 
1360 aa  272  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  31.65 
 
 
1545 aa  271  8.999999999999999e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  31.79 
 
 
1328 aa  269  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  29.38 
 
 
873 aa  268  5e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.23 
 
 
1295 aa  268  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.77 
 
 
1306 aa  268  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.61 
 
 
1306 aa  267  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.61 
 
 
1300 aa  267  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.61 
 
 
1306 aa  267  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  31.68 
 
 
1281 aa  267  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  31.88 
 
 
1294 aa  267  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.51 
 
 
1306 aa  267  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.96 
 
 
1290 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  31.84 
 
 
1296 aa  266  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.84 
 
 
1345 aa  266  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  29.15 
 
 
1312 aa  265  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  31.68 
 
 
1300 aa  265  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.64 
 
 
1300 aa  265  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.68 
 
 
1300 aa  265  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.05 
 
 
1300 aa  265  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.51 
 
 
1300 aa  265  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  31.66 
 
 
1298 aa  265  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.22 
 
 
1300 aa  263  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.79 
 
 
1300 aa  264  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.56 
 
 
1309 aa  263  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  30.69 
 
 
1282 aa  263  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.55 
 
 
1295 aa  263  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.87 
 
 
1300 aa  263  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.55 
 
 
1295 aa  262  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  29.45 
 
 
1329 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  29.65 
 
 
1310 aa  261  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  30.95 
 
 
1307 aa  261  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  31.23 
 
 
1315 aa  260  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.81 
 
 
1295 aa  260  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  28.46 
 
 
697 aa  260  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.95 
 
 
1295 aa  259  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  31.19 
 
 
1312 aa  259  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.95 
 
 
1295 aa  259  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  31.42 
 
 
1281 aa  258  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  30.25 
 
 
769 aa  258  5e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  30.08 
 
 
1306 aa  258  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  30.89 
 
 
1308 aa  257  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  30.65 
 
 
1310 aa  257  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  31.12 
 
 
1316 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  32.36 
 
 
1305 aa  256  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  30.91 
 
 
699 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  30.92 
 
 
830 aa  256  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  32.03 
 
 
1296 aa  256  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  27.6 
 
 
1128 aa  256  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  30.31 
 
 
1374 aa  255  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  30.65 
 
 
1339 aa  254  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  29.22 
 
 
1338 aa  254  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  30.43 
 
 
1075 aa  254  9.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  31.97 
 
 
1318 aa  254  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  29.44 
 
 
1423 aa  254  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  29.78 
 
 
1303 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  30.99 
 
 
1342 aa  254  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  29.39 
 
 
1312 aa  254  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  30.25 
 
 
1293 aa  253  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  29.04 
 
 
1012 aa  253  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  31.93 
 
 
1349 aa  252  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  29.72 
 
 
1326 aa  252  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  30.54 
 
 
670 aa  252  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  29.8 
 
 
1466 aa  252  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.48 
 
 
1303 aa  252  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  31.18 
 
 
1309 aa  252  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  27.7 
 
 
1270 aa  251  5e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  35.22 
 
 
1566 aa  251  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  29.81 
 
 
1326 aa  251  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  30.73 
 
 
1373 aa  251  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  31.51 
 
 
870 aa  250  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  30.61 
 
 
1355 aa  249  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  30.27 
 
 
1301 aa  249  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1419  ATP-dependent helicase HrpA  29.39 
 
 
1421 aa  249  4e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.680764  normal  0.0419537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  29.24 
 
 
1293 aa  249  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>