More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119781 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  100 
 
 		 1545 aa  3173    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  35.9 
 
 		 1041 aa  473  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  41.71 
 
 		 811 aa  412  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  39.32 
 
 		 936 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  41.02 
 
 		 1325 aa  353  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  37.48 
 
 		 1288 aa  309  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  35.25 
 
 		 790 aa  303  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  31.65 
 
 		 1407 aa  270  1e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36189  predicted protein  31.99 
 
 		 998 aa  255  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804187  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  29.98 
 
 		 1436 aa  244  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  30.66 
 
 		 1469 aa  242  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  33.46 
 
 		 1450 aa  241  6.999999999999999e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  33.48 
 
 		 1189 aa  219  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  32.95 
 
 		 1135 aa  218  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  38.51 
 
 		 1581 aa  215  4.9999999999999996e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  33.83 
 
 		 422 aa  213  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  32.2 
 
 		 1241 aa  212  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  31.18 
 
 		 924 aa  205  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  31.66 
 
 		 769 aa  202  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  31.6 
 
 		 1128 aa  200  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  32.52 
 
 		 1075 aa  195  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  30.15 
 
 		 697 aa  193  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  31.66 
 
 		 873 aa  191  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  29.3 
 
 		 989 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  32.35 
 
 		 1312 aa  185  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  30.52 
 
 		 771 aa  185  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  29.11 
 
 		 1261 aa  184  8.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  53.67 
 
 		 528 aa  184  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  30.45 
 
 		 1012 aa  182  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  29.05 
 
 		 699 aa  182  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  30.04 
 
 		 783 aa  181  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  29.48 
 
 		 670 aa  178  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  31.24 
 
 		 1338 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  31.36 
 
 		 1374 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  30.86 
 
 		 1301 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  31.08 
 
 		 1329 aa  176  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  31.31 
 
 		 1301 aa  175  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  30.31 
 
 		 713 aa  176  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  32.15 
 
 		 1303 aa  175  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  36.14 
 
 		 1324 aa  175  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  31.51 
 
 		 1294 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  28.63 
 
 		 720 aa  174  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  31.45 
 
 		 1303 aa  173  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  31.86 
 
 		 1441 aa  174  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  31.67 
 
 		 1303 aa  174  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  30.54 
 
 		 1301 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  31.43 
 
 		 1341 aa  171  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  31.08 
 
 		 1281 aa  171  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 1295 aa  171  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  31.6 
 
 		 1303 aa  171  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  31 
 
 		 1315 aa  170  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  28.67 
 
 		 1312 aa  169  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  30.18 
 
 		 1301 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  31.21 
 
 		 1310 aa  168  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06585  DEAH-box RNA helicase (Dhr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04330)  40.18 
 
 		 956 aa  168  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  31.77 
 
 		 1318 aa  168  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  29.13 
 
 		 1307 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  30.75 
 
 		 1333 aa  167  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  41.01 
 
 		 1270 aa  166  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  31.36 
 
 		 1317 aa  166  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  30.2 
 
 		 1307 aa  165  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  30.7 
 
 		 1316 aa  165  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  27.74 
 
 		 1342 aa  164  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  30.52 
 
 		 1462 aa  164  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  31.39 
 
 		 1298 aa  163  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  35.48 
 
 		 1293 aa  164  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  29.65 
 
 		 1296 aa  164  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  30.52 
 
 		 1375 aa  163  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  30.52 
 
 		 1380 aa  163  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  30.52 
 
 		 1375 aa  163  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  29.75 
 
 		 1326 aa  163  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  31.11 
 
 		 1324 aa  162  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  30.91 
 
 		 1305 aa  162  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0228  ATP-dependent helicase HrpA  31.22 
 
 		 1471 aa  162  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.406446 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.16 
 
 		 1309 aa  162  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  35.06 
 
 		 1331 aa  162  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  29.73 
 
 		 1323 aa  161  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  30.41 
 
 		 1339 aa  161  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  30.27 
 
 		 1326 aa  161  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  30.3 
 
 		 1375 aa  161  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  30.43 
 
 		 1325 aa  160  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  30.3 
 
 		 1375 aa  161  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  30.3 
 
 		 1375 aa  161  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  30.3 
 
 		 1375 aa  161  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  30.3 
 
 		 1375 aa  161  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  35.58 
 
 		 1293 aa  160  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  35.16 
 
 		 1291 aa  160  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  30.56 
 
 		 1378 aa  160  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  35.16 
 
 		 1293 aa  160  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  35.16 
 
 		 1293 aa  159  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  35.16 
 
 		 1293 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  30.43 
 
 		 1310 aa  159  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  33.12 
 
 		 824 aa  158  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  34.92 
 
 		 1295 aa  158  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  34.84 
 
 		 1293 aa  158  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  34.84 
 
 		 1293 aa  158  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.22 
 
 		 1303 aa  158  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.98 
 
 		 1295 aa  158  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  29.98 
 
 		 1339 aa  158  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  26.38 
 
 		 679 aa  157  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>