More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36189 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_36189  predicted protein  100 
 
 
998 aa  2028    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804187  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  32.23 
 
 
1041 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  41.75 
 
 
811 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  33.16 
 
 
936 aa  281  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  31.99 
 
 
1545 aa  263  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  33.55 
 
 
790 aa  235  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  34 
 
 
1436 aa  234  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  39.13 
 
 
1581 aa  228  4e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  34.77 
 
 
1325 aa  221  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  33.75 
 
 
1407 aa  219  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  34.67 
 
 
1288 aa  214  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  40.6 
 
 
528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  41.22 
 
 
1450 aa  197  9e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  31.92 
 
 
670 aa  174  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06585  DEAH-box RNA helicase (Dhr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04330)  42.4 
 
 
956 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  34.97 
 
 
697 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  34.09 
 
 
1270 aa  167  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  31.42 
 
 
1135 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  32.23 
 
 
1312 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  33.42 
 
 
713 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  43.81 
 
 
1241 aa  165  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  35.37 
 
 
1376 aa  165  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  33.22 
 
 
422 aa  165  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  41.22 
 
 
1374 aa  164  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  34.01 
 
 
720 aa  164  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  40.24 
 
 
1326 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  31.56 
 
 
1329 aa  163  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  34.93 
 
 
1378 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  40.24 
 
 
1326 aa  163  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_708  predicted protein  40.78 
 
 
511 aa  161  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  34.16 
 
 
1342 aa  161  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 
1402 aa  160  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  31.36 
 
 
1275 aa  160  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  30.85 
 
 
1469 aa  160  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 
1402 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 
1298 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 
1314 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 
1222 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 
1403 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  31.66 
 
 
924 aa  159  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  39.04 
 
 
1338 aa  159  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  32.6 
 
 
1320 aa  159  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  36.68 
 
 
1303 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  33.73 
 
 
1462 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  32.32 
 
 
1428 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  31.98 
 
 
1323 aa  157  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  37.11 
 
 
1303 aa  158  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  32.52 
 
 
1281 aa  157  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  39.22 
 
 
1341 aa  157  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  41.45 
 
 
771 aa  157  9e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  36.59 
 
 
1303 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  33.43 
 
 
1375 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  35.21 
 
 
1301 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  35.21 
 
 
1301 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  33.06 
 
 
1307 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  33.43 
 
 
1375 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  35.59 
 
 
1189 aa  156  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  33.43 
 
 
1375 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  33.43 
 
 
1380 aa  156  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  33.43 
 
 
1375 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  30.85 
 
 
1310 aa  156  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  33.43 
 
 
1375 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  33.55 
 
 
1328 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  31.25 
 
 
1075 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  33.13 
 
 
1375 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  32.06 
 
 
1312 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  33.13 
 
 
1375 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  30.32 
 
 
1128 aa  155  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  39.22 
 
 
769 aa  155  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  31.45 
 
 
1329 aa  155  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  33.64 
 
 
1317 aa  155  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  32.54 
 
 
1316 aa  155  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  35.21 
 
 
1301 aa  155  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  29.65 
 
 
873 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  30.37 
 
 
1296 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  32.75 
 
 
1306 aa  154  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  33.02 
 
 
1360 aa  154  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  33 
 
 
1012 aa  154  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  30.83 
 
 
783 aa  154  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  34.29 
 
 
1310 aa  154  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  42.2 
 
 
1312 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  33.67 
 
 
870 aa  153  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  43.87 
 
 
1295 aa  153  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  33.15 
 
 
1298 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  36.09 
 
 
1402 aa  152  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  38.34 
 
 
844 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.61 
 
 
1298 aa  151  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  41.15 
 
 
1303 aa  151  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  31.25 
 
 
1290 aa  151  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  35.56 
 
 
1301 aa  151  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4670  ATP-dependent helicase HrpA  34.38 
 
 
1333 aa  151  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.157839  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  38.65 
 
 
1261 aa  150  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  43.88 
 
 
1290 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  39.7 
 
 
989 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  31.1 
 
 
1310 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  31.4 
 
 
1331 aa  149  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  32.52 
 
 
699 aa  149  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  40.99 
 
 
1294 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  38.37 
 
 
1441 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  30.81 
 
 
1333 aa  148  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>