More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42076 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  100 
 
 		 528 aa  1076    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  39.78 
 
 		 811 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  41.42 
 
 		 936 aa  362  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  38.1 
 
 		 790 aa  331  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  37.2 
 
 		 1436 aa  329  8e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  37.62 
 
 		 1288 aa  322  7e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  36.47 
 
 		 1041 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  39.02 
 
 		 1325 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  32.9 
 
 		 1407 aa  290  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  34.79 
 
 		 873 aa  286  5.999999999999999e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  34.77 
 
 		 1135 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  34.36 
 
 		 1581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  35.35 
 
 		 1261 aa  283  6.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  33.96 
 
 		 1241 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  36.5 
 
 		 1326 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  35.93 
 
 		 1326 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  33.58 
 
 		 771 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  36.07 
 
 		 1374 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  35.43 
 
 		 1338 aa  276  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  35.36 
 
 		 1303 aa  273  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  34.95 
 
 		 924 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  34.15 
 
 		 989 aa  271  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  33.33 
 
 		 769 aa  270  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  35.63 
 
 		 1310 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  35 
 
 		 720 aa  267  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  34.73 
 
 		 1331 aa  267  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  33.97 
 
 		 1316 aa  263  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  33.65 
 
 		 1310 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  33.27 
 
 		 1312 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  33.97 
 
 		 1303 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  33.21 
 
 		 1316 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  36.24 
 
 		 1301 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  33.91 
 
 		 1310 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  34.16 
 
 		 1303 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  31.42 
 
 		 783 aa  258  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  33.84 
 
 		 1462 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  33.52 
 
 		 1333 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  33.65 
 
 		 1281 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  34.23 
 
 		 1378 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  32.7 
 
 		 870 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  33.83 
 
 		 1402 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  34.35 
 
 		 1308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 		 1342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  35.18 
 
 		 1317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  34.67 
 
 		 1294 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  35.58 
 
 		 1324 aa  254  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  37.94 
 
 		 1469 aa  254  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  34.65 
 
 		 713 aa  254  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  32.97 
 
 		 1376 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  33.52 
 
 		 1330 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  33.84 
 
 		 1306 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  34.36 
 
 		 1305 aa  253  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  35.17 
 
 		 1301 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  35.17 
 
 		 1301 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  32.95 
 
 		 1293 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  32.5 
 
 		 1075 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  33.14 
 
 		 1323 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  35.29 
 
 		 1297 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1546  ATP-dependent helicase HrpA  33.96 
 
 		 1341 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  33.27 
 
 		 1318 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  33.08 
 
 		 1326 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  32.96 
 
 		 1282 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  33.77 
 
 		 1341 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  33.78 
 
 		 1339 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  35.54 
 
 		 1301 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  35.56 
 
 		 1331 aa  250  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  32.95 
 
 		 1402 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  32.9 
 
 		 679 aa  250  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1402 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  32.76 
 
 		 1293 aa  250  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.95 
 
 		 1290 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1314 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  35.06 
 
 		 1315 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  33.78 
 
 		 1329 aa  249  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  33.65 
 
 		 1351 aa  249  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  32.76 
 
 		 1293 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  33.72 
 
 		 1289 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1403 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  34.35 
 
 		 1324 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  32.63 
 
 		 724 aa  248  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  32.89 
 
 		 1428 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2106  ATP-dependent helicase HrpA  33.21 
 
 		 1298 aa  248  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.426464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  33.27 
 
 		 1309 aa  248  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  32.57 
 
 		 1305 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  32.57 
 
 		 1293 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  32.76 
 
 		 1296 aa  247  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  32.5 
 
 		 1293 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  33.15 
 
 		 1320 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  32.69 
 
 		 1293 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  32.69 
 
 		 1293 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  32.12 
 
 		 1296 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  32.31 
 
 		 1380 aa  246  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  32.69 
 
 		 1291 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  33.08 
 
 		 1295 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.38 
 
 		 1295 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  32.13 
 
 		 1329 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  32.5 
 
 		 1375 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  33.46 
 
 		 1298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  32.5 
 
 		 1375 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  33.52 
 
 		 699 aa  244  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>