More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05839 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  100 
 
 
1436 aa  2981    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  33.92 
 
 
1450 aa  676    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  34.43 
 
 
811 aa  432  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  33.92 
 
 
936 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  33.71 
 
 
1041 aa  418  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  36.34 
 
 
790 aa  418  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  34.78 
 
 
1288 aa  387  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  34.01 
 
 
1407 aa  372  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  31.95 
 
 
1325 aa  354  8.999999999999999e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  35.88 
 
 
1581 aa  350  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  37.02 
 
 
528 aa  313  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  32.85 
 
 
1326 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  32.52 
 
 
1326 aa  297  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  30.25 
 
 
697 aa  295  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  32.15 
 
 
1374 aa  295  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  31.75 
 
 
1338 aa  292  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  32.05 
 
 
1303 aa  289  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  30.52 
 
 
1012 aa  288  8e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  30.76 
 
 
1294 aa  286  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  31.36 
 
 
1281 aa  284  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  29.08 
 
 
1241 aa  283  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  29.4 
 
 
1075 aa  280  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  31.02 
 
 
1301 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  29.03 
 
 
720 aa  280  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  31.08 
 
 
1303 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  31.03 
 
 
1301 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  30.74 
 
 
1301 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  30.93 
 
 
1303 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  33.28 
 
 
1469 aa  275  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  30.76 
 
 
1135 aa  275  5.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  30.56 
 
 
1261 aa  274  8.000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  33.06 
 
 
1275 aa  273  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  30.87 
 
 
1301 aa  273  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  29.05 
 
 
783 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  30.77 
 
 
1312 aa  272  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  31.36 
 
 
1307 aa  271  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  29.12 
 
 
873 aa  270  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  29.86 
 
 
1318 aa  266  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  30.23 
 
 
1355 aa  265  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  29.09 
 
 
924 aa  264  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.55 
 
 
1295 aa  264  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.96 
 
 
1300 aa  263  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  28.81 
 
 
1300 aa  262  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  29.64 
 
 
1324 aa  262  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.81 
 
 
1300 aa  262  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  30.94 
 
 
1290 aa  262  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  29.25 
 
 
1281 aa  261  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  30.02 
 
 
870 aa  262  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.09 
 
 
1306 aa  261  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.81 
 
 
1300 aa  261  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.81 
 
 
1300 aa  261  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.93 
 
 
1300 aa  261  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.09 
 
 
1306 aa  261  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.81 
 
 
1300 aa  261  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  29.89 
 
 
1282 aa  261  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.93 
 
 
1306 aa  261  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.93 
 
 
1306 aa  260  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  31.24 
 
 
1329 aa  260  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.83 
 
 
1300 aa  260  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  29.59 
 
 
989 aa  259  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  27.95 
 
 
1303 aa  259  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  28.66 
 
 
1342 aa  258  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  31.69 
 
 
1312 aa  258  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  29.55 
 
 
1339 aa  258  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.9 
 
 
1295 aa  257  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  31.81 
 
 
1309 aa  257  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  29.64 
 
 
1282 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0283  ATP-dependent helicase HrpA  30.18 
 
 
1394 aa  256  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  30.08 
 
 
1318 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  29.98 
 
 
1295 aa  255  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  30.77 
 
 
1308 aa  255  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  30.23 
 
 
1310 aa  255  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  28.4 
 
 
1316 aa  254  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  29.94 
 
 
1306 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  29.72 
 
 
1293 aa  254  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.28 
 
 
1298 aa  254  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.81 
 
 
1309 aa  254  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.59 
 
 
1300 aa  254  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  29.7 
 
 
1331 aa  251  9e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  31.01 
 
 
1428 aa  250  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  29.55 
 
 
1310 aa  250  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  29.79 
 
 
1315 aa  249  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  31.18 
 
 
1320 aa  250  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  30.91 
 
 
1462 aa  250  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  29.15 
 
 
1325 aa  249  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  30.51 
 
 
1403 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  29.58 
 
 
1293 aa  249  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  30.35 
 
 
1380 aa  249  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  29.58 
 
 
1293 aa  249  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  30.32 
 
 
1306 aa  249  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  29.55 
 
 
1402 aa  248  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  29.08 
 
 
1293 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  29.58 
 
 
1291 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  28.9 
 
 
1339 aa  248  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  28.98 
 
 
1328 aa  247  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  30.88 
 
 
1312 aa  247  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  30.3 
 
 
1378 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  30.35 
 
 
1375 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  30.35 
 
 
1375 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  29.98 
 
 
1324 aa  246  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>