More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23865 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  49.7 
 
 		 1128 aa  648    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  50.77 
 
 		 1241 aa  664    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  58.99 
 
 		 769 aa  820    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  50.93 
 
 		 873 aa  636    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  47.42 
 
 		 1189 aa  647    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  60.14 
 
 		 783 aa  823    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  49.85 
 
 		 1012 aa  650    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  61.67 
 
 		 697 aa  889    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  52.14 
 
 		 1135 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  57.54 
 
 		 771 aa  795    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  100 
 
 		 720 aa  1496    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  47.93 
 
 		 1075 aa  618  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  46.26 
 
 		 924 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  44.55 
 
 		 989 aa  592  1e-167  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  42.35 
 
 		 1261 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  46.15 
 
 		 699 aa  570  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  43.31 
 
 		 679 aa  550  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  43.56 
 
 		 670 aa  511  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  41.23 
 
 		 713 aa  498  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  41.26 
 
 		 724 aa  490  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  38.28 
 
 		 830 aa  469  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  38.29 
 
 		 1294 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  40.6 
 
 		 665 aa  446  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  37.21 
 
 		 824 aa  443  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  38.36 
 
 		 1326 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  37.8 
 
 		 1326 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  36.98 
 
 		 1342 aa  428  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  37.89 
 
 		 1298 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  38.94 
 
 		 1312 aa  423  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  38.39 
 
 		 1307 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  37.43 
 
 		 1303 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  36.28 
 
 		 1281 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  37.63 
 
 		 1303 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  36.89 
 
 		 1318 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  36.55 
 
 		 1275 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  37.04 
 
 		 1303 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  36.58 
 
 		 1312 aa  419  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  37.57 
 
 		 1290 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  37.72 
 
 		 1307 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.06 
 
 		 1298 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.83 
 
 		 1290 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  37.57 
 
 		 651 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.38 
 
 		 1309 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  37.72 
 
 		 1315 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  36.6 
 
 		 1338 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  35.01 
 
 		 1329 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  36.72 
 
 		 1303 aa  412  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  35.84 
 
 		 1282 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  37.1 
 
 		 1310 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  36.4 
 
 		 1318 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  35.02 
 
 		 1328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.85 
 
 		 1303 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.04 
 
 		 1345 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  35.46 
 
 		 1293 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.34 
 
 		 1295 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  37.72 
 
 		 1301 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  34.83 
 
 		 1293 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.02 
 
 		 1295 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  36.39 
 
 		 1329 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  37.12 
 
 		 1312 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  35.46 
 
 		 1291 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  37.76 
 
 		 1317 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  34.83 
 
 		 1293 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  35.52 
 
 		 1293 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  37.32 
 
 		 1339 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  35.46 
 
 		 1293 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  35.58 
 
 		 1308 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  34.99 
 
 		 1291 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  36.29 
 
 		 1374 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  35.46 
 
 		 1293 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  34.83 
 
 		 1293 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  34.83 
 
 		 1293 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  35.31 
 
 		 1281 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  35.93 
 
 		 1295 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  36.68 
 
 		 1306 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  37.41 
 
 		 1311 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  36.35 
 
 		 1341 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  36.44 
 
 		 1291 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  36.88 
 
 		 1310 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  398  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  35.48 
 
 		 1289 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  35.33 
 
 		 1295 aa  399  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  35.31 
 
 		 1300 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  37.28 
 
 		 1301 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.87 
 
 		 1306 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.71 
 
 		 1306 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  37.28 
 
 		 1301 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  34.41 
 
 		 1296 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.87 
 
 		 1306 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.15 
 
 		 1295 aa  395  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  36.79 
 
 		 1339 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.31 
 
 		 1300 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.31 
 
 		 1300 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  35.2 
 
 		 1296 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.87 
 
 		 1300 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.87 
 
 		 1306 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.51 
 
 		 1295 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>