More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31907 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  100 
 
 
830 aa  1711    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  37.12 
 
 
1189 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  40.69 
 
 
873 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  37.25 
 
 
824 aa  467  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  39.76 
 
 
1135 aa  466  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  39.54 
 
 
1012 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  37.97 
 
 
699 aa  462  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  37.99 
 
 
720 aa  466  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  38.29 
 
 
679 aa  466  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  38.56 
 
 
1075 aa  462  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  38.12 
 
 
1241 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  37.96 
 
 
783 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  39.37 
 
 
771 aa  453  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  38.56 
 
 
1128 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  37.88 
 
 
769 aa  442  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  37.66 
 
 
697 aa  441  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  36.5 
 
 
1261 aa  427  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  36.12 
 
 
924 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  37.66 
 
 
670 aa  422  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  35.99 
 
 
989 aa  411  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  36.03 
 
 
713 aa  403  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  34.34 
 
 
814 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  34.68 
 
 
724 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  35.97 
 
 
665 aa  362  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  34.05 
 
 
1341 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  33.24 
 
 
1303 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  32.61 
 
 
1290 aa  353  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.2 
 
 
1290 aa  351  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  32.33 
 
 
1312 aa  350  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  33.05 
 
 
1324 aa  346  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  33.58 
 
 
1298 aa  345  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  33.57 
 
 
1342 aa  345  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  33.96 
 
 
1294 aa  343  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  32.87 
 
 
1326 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  33.24 
 
 
1303 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  34.12 
 
 
1312 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  32.87 
 
 
1326 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  33.38 
 
 
1328 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  32.77 
 
 
1303 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.53 
 
 
1345 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  32.9 
 
 
1303 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.72 
 
 
1295 aa  337  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  32.19 
 
 
1374 aa  337  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  32.12 
 
 
1338 aa  337  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  32.58 
 
 
1306 aa  337  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  33.7 
 
 
1315 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.44 
 
 
1295 aa  336  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.9 
 
 
1309 aa  335  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  33.43 
 
 
1318 aa  335  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  31 
 
 
1316 aa  335  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  33.38 
 
 
1329 aa  334  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  32.08 
 
 
1295 aa  333  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  32.81 
 
 
1281 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.29 
 
 
1306 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.43 
 
 
1306 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.43 
 
 
1306 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  32.05 
 
 
1339 aa  332  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.86 
 
 
1306 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  32.42 
 
 
1291 aa  332  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.43 
 
 
1300 aa  331  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.62 
 
 
1303 aa  331  3e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.81 
 
 
1300 aa  331  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  32.67 
 
 
1300 aa  331  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  33.53 
 
 
1318 aa  331  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.67 
 
 
1300 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.24 
 
 
1300 aa  330  6e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.57 
 
 
1298 aa  330  6e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.67 
 
 
1300 aa  330  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.15 
 
 
1295 aa  330  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.67 
 
 
1300 aa  330  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.26 
 
 
1295 aa  330  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.99 
 
 
1300 aa  330  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  32.43 
 
 
1308 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  32.86 
 
 
1281 aa  328  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  31.99 
 
 
1293 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 
823 aa  327  4.0000000000000003e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  32.75 
 
 
1325 aa  327  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  33.91 
 
 
1301 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  33.91 
 
 
1301 aa  327  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  31.99 
 
 
1293 aa  326  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  32.63 
 
 
1282 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  31.59 
 
 
1367 aa  325  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  31.99 
 
 
1293 aa  324  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  31.11 
 
 
1339 aa  323  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  31.59 
 
 
1293 aa  323  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2723  ATP-dependent helicase HrpA  33.85 
 
 
1289 aa  323  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  31.87 
 
 
1289 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  33.1 
 
 
1301 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  31.59 
 
 
1293 aa  321  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  32.15 
 
 
1293 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  32.81 
 
 
1296 aa  322  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  33.24 
 
 
1301 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  32.26 
 
 
1331 aa  321  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  39.17 
 
 
1341 aa  321  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  31.51 
 
 
1311 aa  321  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  32.23 
 
 
1310 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  31.86 
 
 
1310 aa  320  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  32.34 
 
 
1310 aa  320  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1546  ATP-dependent helicase HrpA  38.96 
 
 
1341 aa  320  9e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  32.34 
 
 
1349 aa  319  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>