More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20335 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  100 
 
 
665 aa  1372    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  43.62 
 
 
1189 aa  489  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  42.92 
 
 
1012 aa  488  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  40.63 
 
 
873 aa  487  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  41.87 
 
 
1135 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  41.55 
 
 
1241 aa  484  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  41.15 
 
 
1075 aa  485  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  41.08 
 
 
679 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  40.87 
 
 
720 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  39.17 
 
 
989 aa  462  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  40.46 
 
 
697 aa  464  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  38.77 
 
 
699 aa  459  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  39.4 
 
 
1261 aa  460  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  41.82 
 
 
771 aa  459  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  39.48 
 
 
924 aa  451  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  38.95 
 
 
1128 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  40.15 
 
 
783 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  40.03 
 
 
769 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  40.33 
 
 
670 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  36.95 
 
 
713 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  35.85 
 
 
824 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  36.26 
 
 
830 aa  385  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  37.63 
 
 
1290 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  37.25 
 
 
724 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  35.42 
 
 
1303 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  35.86 
 
 
1303 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  36.44 
 
 
1312 aa  355  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  33.75 
 
 
814 aa  355  2e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  35.21 
 
 
1312 aa  354  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  34.77 
 
 
1305 aa  353  5e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  35.02 
 
 
651 aa  350  5e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.44 
 
 
1303 aa  346  7e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  34.86 
 
 
1294 aa  345  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  34.44 
 
 
1303 aa  343  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  33.67 
 
 
1326 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  34.72 
 
 
1281 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  36.54 
 
 
1312 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  33.67 
 
 
1326 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  34.3 
 
 
1307 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.07 
 
 
1295 aa  340  7e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  33.84 
 
 
1296 aa  340  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  34.73 
 
 
1296 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.99 
 
 
1290 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  35.35 
 
 
1301 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  32.98 
 
 
1308 aa  335  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.69 
 
 
1300 aa  335  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  35.21 
 
 
1323 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.54 
 
 
1306 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  32.93 
 
 
1328 aa  334  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  35.35 
 
 
1301 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  35.2 
 
 
1301 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  33.54 
 
 
1300 aa  333  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.54 
 
 
1300 aa  333  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.54 
 
 
1300 aa  333  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.38 
 
 
1306 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.54 
 
 
1300 aa  333  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.54 
 
 
1300 aa  333  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.38 
 
 
1306 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.54 
 
 
1306 aa  333  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.54 
 
 
1300 aa  332  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.38 
 
 
1300 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  35.45 
 
 
1311 aa  332  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  34.54 
 
 
1333 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  33.38 
 
 
1281 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  34.34 
 
 
1331 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  34.54 
 
 
1310 aa  332  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  35.05 
 
 
1301 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  34.12 
 
 
1324 aa  332  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.23 
 
 
1345 aa  330  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  33.38 
 
 
1342 aa  329  8e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  33.86 
 
 
1367 aa  329  8e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  34.75 
 
 
1324 aa  329  9e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  31.49 
 
 
823 aa  329  1.0000000000000001e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.4 
 
 
1295 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2106  ATP-dependent helicase HrpA  34.78 
 
 
1298 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.426464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  33.05 
 
 
1338 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.33 
 
 
1295 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.62 
 
 
1295 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.62 
 
 
1295 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.98 
 
 
1295 aa  327  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.23 
 
 
1295 aa  326  7e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  36.01 
 
 
1317 aa  326  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  33.83 
 
 
1275 aa  326  9e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.54 
 
 
1300 aa  326  9e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  34.51 
 
 
1316 aa  325  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  33.38 
 
 
1329 aa  325  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.13 
 
 
1309 aa  325  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.11 
 
 
1298 aa  323  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  34.7 
 
 
1428 aa  323  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  32.66 
 
 
1326 aa  323  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  33.53 
 
 
1306 aa  323  9.000000000000001e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2723  ATP-dependent helicase HrpA  33.73 
 
 
1289 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  32.31 
 
 
1293 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  34.54 
 
 
1307 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  33.03 
 
 
1289 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  35.29 
 
 
1310 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  34.12 
 
 
1380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  34.15 
 
 
1303 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  34.38 
 
 
1325 aa  321  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  34.53 
 
 
1305 aa  321  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.616216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>