More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0856 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  100 
 
 		 823 aa  1651    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  41.87 
 
 		 870 aa  624  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  37.82 
 
 		 1075 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.84 
 
 		 1298 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  37.46 
 
 		 873 aa  420  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  35.68 
 
 		 1298 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.62 
 
 		 1300 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  35.46 
 
 		 1312 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  35.46 
 
 		 1281 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  415  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  415  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  415  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  33.39 
 
 		 1290 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  416  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  34.84 
 
 		 1342 aa  415  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  35.29 
 
 		 1318 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  36.54 
 
 		 1308 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.46 
 
 		 1300 aa  415  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.83 
 
 		 1303 aa  413  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  36.66 
 
 		 1305 aa  416  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  38 
 
 		 1128 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.41 
 
 		 1295 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.41 
 
 		 1295 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  35.8 
 
 		 1303 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  32.97 
 
 		 1306 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  35.96 
 
 		 1303 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  34.58 
 
 		 1324 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.14 
 
 		 1306 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.14 
 
 		 1300 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.14 
 
 		 1306 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.14 
 
 		 1306 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.14 
 
 		 1306 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  37.16 
 
 		 1328 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  36.03 
 
 		 1295 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  34.18 
 
 		 1294 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  35.46 
 
 		 1295 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  35.26 
 
 		 1281 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  34.22 
 
 		 1312 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.39 
 
 		 1295 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  33.65 
 
 		 1316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  35.41 
 
 		 1293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  34.49 
 
 		 1303 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  32.83 
 
 		 1293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37 
 
 		 1345 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  34.98 
 
 		 1293 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.29 
 
 		 1295 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.29 
 
 		 1300 aa  405  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  34.6 
 
 		 1326 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  35.97 
 
 		 1296 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  35.33 
 
 		 1305 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  35.41 
 
 		 1293 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  34.91 
 
 		 1326 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.92 
 
 		 1295 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  34.12 
 
 		 1310 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  35.25 
 
 		 1293 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  34.82 
 
 		 1303 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.92 
 
 		 1295 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  35.25 
 
 		 1315 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  35.96 
 
 		 1012 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.2 
 
 		 1309 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  34.88 
 
 		 1282 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  34.45 
 
 		 1293 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  34.99 
 
 		 1291 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  33.18 
 
 		 1282 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  33.12 
 
 		 1310 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  35.74 
 
 		 1241 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  32.1 
 
 		 1307 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  34.93 
 
 		 1291 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  35.86 
 
 		 1189 aa  398  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  34.93 
 
 		 1293 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  34.77 
 
 		 1291 aa  399  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  32.07 
 
 		 1325 aa  399  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.5 
 
 		 1290 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  33.03 
 
 		 1339 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  35.56 
 
 		 697 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  31.87 
 
 		 1289 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  34.93 
 
 		 1293 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  33.39 
 
 		 1307 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  34.83 
 
 		 1291 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  34.6 
 
 		 1318 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.76 
 
 		 1295 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  33.53 
 
 		 1309 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0980  ATP-dependent helicase HrpA  36.51 
 
 		 1307 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  32.77 
 
 		 1317 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  32.88 
 
 		 1339 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  35.1 
 
 		 1291 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  35.36 
 
 		 769 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  34.91 
 
 		 1331 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  32.82 
 
 		 1338 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  33.84 
 
 		 1275 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  33.28 
 
 		 1312 aa  389  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  34.98 
 
 		 1296 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  30.46 
 
 		 1311 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  35.17 
 
 		 1301 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  35.02 
 
 		 1301 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  33.75 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  36.69 
 
 		 1135 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  34.78 
 
 		 1330 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  35.35 
 
 		 924 aa  382  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>