More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1654 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  100 
 
 		 870 aa  1786    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  42.08 
 
 		 823 aa  625  1e-177  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  36.5 
 
 		 1342 aa  439  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  39.59 
 
 		 1298 aa  436  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  38.28 
 
 		 1294 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  38.64 
 
 		 1305 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  35.65 
 
 		 1309 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  39.02 
 
 		 1303 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  38.06 
 
 		 1312 aa  419  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.89 
 
 		 1309 aa  419  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.66 
 
 		 1303 aa  419  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.29 
 
 		 1298 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  37.83 
 
 		 1289 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.21 
 
 		 1300 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  38.43 
 
 		 1324 aa  415  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  37.99 
 
 		 1281 aa  415  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  38.2 
 
 		 1318 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  37.92 
 
 		 1308 aa  416  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  37.58 
 
 		 1328 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.92 
 
 		 1290 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  36.64 
 
 		 1312 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  36.89 
 
 		 1281 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  37.05 
 
 		 1300 aa  412  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.68 
 
 		 1345 aa  412  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  37.46 
 
 		 1303 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.89 
 
 		 1300 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.19 
 
 		 1306 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.05 
 
 		 1300 aa  412  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  37.65 
 
 		 1275 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  37.3 
 
 		 1303 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.05 
 
 		 1300 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.56 
 
 		 1295 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  36.48 
 
 		 1326 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.05 
 
 		 1300 aa  412  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.05 
 
 		 1300 aa  412  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  36.61 
 
 		 1326 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  36.91 
 
 		 1282 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.03 
 
 		 1306 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  37.21 
 
 		 1316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0980  ATP-dependent helicase HrpA  38.24 
 
 		 1307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  36.1 
 
 		 1303 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.03 
 
 		 1306 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  36.99 
 
 		 1301 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.19 
 
 		 1295 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  37.93 
 
 		 1291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.03 
 
 		 1306 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  38.11 
 
 		 1293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.03 
 
 		 1300 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  37.15 
 
 		 1301 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  37.13 
 
 		 1329 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  37.15 
 
 		 1301 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  38.11 
 
 		 1293 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  36.68 
 
 		 1306 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.74 
 
 		 1300 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  37.11 
 
 		 1295 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  38.11 
 
 		 1293 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  35.67 
 
 		 1282 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  37.02 
 
 		 1293 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  37.62 
 
 		 1295 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  36.67 
 
 		 1312 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  37.16 
 
 		 1310 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  36.19 
 
 		 1307 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  36.42 
 
 		 1135 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  37.48 
 
 		 1293 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  35.76 
 
 		 1318 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  36.87 
 
 		 1293 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  36.87 
 
 		 1293 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  36.99 
 
 		 1301 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  37.95 
 
 		 1291 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  37.92 
 
 		 1315 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  39.64 
 
 		 1360 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  37.17 
 
 		 1310 aa  399  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  36.41 
 
 		 1293 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.69 
 
 		 1295 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  37.88 
 
 		 1296 aa  399  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  37.18 
 
 		 1325 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.21 
 
 		 1295 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  38.23 
 
 		 1291 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  36.21 
 
 		 1296 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  36.57 
 
 		 1462 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.85 
 
 		 1295 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  36.34 
 
 		 1329 aa  395  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  37.5 
 
 		 1317 aa  396  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  35.15 
 
 		 1338 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  36.08 
 
 		 1367 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  36.82 
 
 		 1291 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  35.09 
 
 		 1241 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  36.64 
 
 		 1291 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  35.7 
 
 		 1339 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  36.59 
 
 		 1331 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  36.42 
 
 		 1320 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  36.34 
 
 		 1075 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  35.79 
 
 		 1189 aa  390  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2723  ATP-dependent helicase HrpA  35.81 
 
 		 1289 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  36.36 
 
 		 1428 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  35.42 
 
 		 1339 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.91 
 
 		 1295 aa  393  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.91 
 
 		 1295 aa  393  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  36.61 
 
 		 1306 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  35.35 
 
 		 1326 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>