More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3101 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  66.01 
 
 		 1478 aa  1876    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  39.07 
 
 		 1330 aa  838    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.24 
 
 		 1300 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  35.72 
 
 		 1378 aa  680    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  57.6 
 
 		 1300 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  41.16 
 
 		 1339 aa  908    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  56.96 
 
 		 1295 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  54.58 
 
 		 1309 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  57.07 
 
 		 1281 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  55.24 
 
 		 1300 aa  653    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  56.54 
 
 		 1295 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  39.3 
 
 		 1306 aa  818    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  55.86 
 
 		 1301 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.24 
 
 		 1345 aa  656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  34.48 
 
 		 1566 aa  731    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  56.01 
 
 		 1295 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  59.61 
 
 		 1331 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  39 
 
 		 1375 aa  950    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  66.49 
 
 		 1466 aa  1886    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  54.86 
 
 		 1293 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  57.12 
 
 		 1303 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  40.85 
 
 		 1339 aa  918    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  42.3 
 
 		 1290 aa  926    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  55.78 
 
 		 1293 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  55.78 
 
 		 1293 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  45 
 
 		 1374 aa  1028    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  56.01 
 
 		 1295 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  43.95 
 
 		 1338 aa  1005    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0283  ATP-dependent helicase HrpA  40.42 
 
 		 1394 aa  818    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.24 
 
 		 1300 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.57 
 
 		 1306 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  56.51 
 
 		 1301 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  57.12 
 
 		 1303 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  37.85 
 
 		 1423 aa  850    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  56.54 
 
 		 1295 aa  650    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  40.56 
 
 		 1298 aa  902    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  42.32 
 
 		 1323 aa  914    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  42.13 
 
 		 1275 aa  886    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  44.68 
 
 		 1326 aa  1008    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.34 
 
 		 1298 aa  657    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  43.19 
 
 		 1281 aa  1043    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  58.29 
 
 		 1303 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.57 
 
 		 1300 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.41 
 
 		 1306 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  55.78 
 
 		 1293 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  55.61 
 
 		 1291 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  100 
 
 		 1360 aa  2728    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  39.27 
 
 		 1342 aa  923    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  41.21 
 
 		 1329 aa  896    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1546  ATP-dependent helicase HrpA  39.57 
 
 		 1341 aa  864    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  39.91 
 
 		 1353 aa  857    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  37.05 
 
 		 1435 aa  800    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  38.94 
 
 		 1438 aa  862    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0808  ATP-dependent helicase HrpA  37.21 
 
 		 1231 aa  699    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  42.06 
 
 		 1333 aa  887    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  55.28 
 
 		 1296 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  56.54 
 
 		 1295 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  39.48 
 
 		 1376 aa  666    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  55.8 
 
 		 1310 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.41 
 
 		 1300 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  40.86 
 
 		 1349 aa  873    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  56.03 
 
 		 1301 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  41.87 
 
 		 1325 aa  962    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3104  ATP-dependent helicase HrpA  40.62 
 
 		 1388 aa  796    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.623202  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1419  ATP-dependent helicase HrpA  38.15 
 
 		 1421 aa  858    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.680764  normal  0.0419537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  41.74 
 
 		 1316 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.07 
 
 		 1300 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.57 
 
 		 1306 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  42.7 
 
 		 1312 aa  949    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  54.65 
 
 		 1282 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.41 
 
 		 1306 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  52.82 
 
 		 1318 aa  651    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  56.54 
 
 		 1295 aa  649    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.06 
 
 		 1303 aa  657    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  55.61 
 
 		 1295 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  55.44 
 
 		 1293 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  55.1 
 
 		 1293 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  39.27 
 
 		 1351 aa  839    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  43.99 
 
 		 1341 aa  1002    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  40.51 
 
 		 1331 aa  845    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  39.72 
 
 		 1341 aa  862    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  41.49 
 
 		 1310 aa  877    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  44.72 
 
 		 1326 aa  1007    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  38.1 
 
 		 1326 aa  832    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.24 
 
 		 1300 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  37.49 
 
 		 1309 aa  775    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  54.37 
 
 		 1308 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  38.26 
 
 		 1305 aa  820    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  56.01 
 
 		 1293 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  55.61 
 
 		 1293 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  54.76 
 
 		 1291 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  57.75 
 
 		 1306 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  56.34 
 
 		 1295 aa  644    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  54.28 
 
 		 1289 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2556  ATP-dependent helicase HrpA  42.23 
 
 		 1341 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0904088  hitchhiker  0.00638433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.24 
 
 		 1300 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  54.38 
 
 		 1296 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  77.93 
 
 		 1373 aa  2086    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  38.34 
 
 		 1367 aa  772    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  55.72 
 
 		 1312 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>