More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01578 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  52.79 
 
 		 1298 aa  643    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  43.7 
 
 		 1338 aa  991    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.48 
 
 		 1300 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  68.8 
 
 		 1478 aa  1969    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  38.99 
 
 		 1351 aa  825    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  55.44 
 
 		 1293 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  38.8 
 
 		 1378 aa  659    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  56.35 
 
 		 1295 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.21 
 
 		 1300 aa  885    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  54.38 
 
 		 1281 aa  638    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  53.48 
 
 		 1300 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  40.44 
 
 		 1441 aa  882    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  42.37 
 
 		 1349 aa  874    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  36.63 
 
 		 1361 aa  640    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  38.28 
 
 		 1375 aa  934    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.01 
 
 		 1306 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  54.62 
 
 		 1293 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  51.94 
 
 		 1303 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  51.36 
 
 		 1328 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  39.02 
 
 		 1438 aa  863    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.41 
 
 		 1295 aa  884    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.28 
 
 		 1309 aa  653    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  52.68 
 
 		 1301 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  41.34 
 
 		 1298 aa  872    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01010  ATP-dependent helicase HrpA  39.74 
 
 		 1560 aa  846    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.573164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  52.24 
 
 		 1303 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  37.44 
 
 		 1423 aa  840    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  42.66 
 
 		 1323 aa  952    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  42.91 
 
 		 1275 aa  886    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  55.56 
 
 		 1295 aa  646    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  57.95 
 
 		 1281 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  57.96 
 
 		 1303 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  43.3 
 
 		 1312 aa  939    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  68.87 
 
 		 1466 aa  1969    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  37.85 
 
 		 1435 aa  811    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.2 
 
 		 1295 aa  886    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.65 
 
 		 1300 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  53.64 
 
 		 1342 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  40.66 
 
 		 1329 aa  895    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  56.39 
 
 		 1310 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  77.57 
 
 		 1360 aa  2065    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  41.51 
 
 		 1355 aa  890    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3104  ATP-dependent helicase HrpA  40.79 
 
 		 1388 aa  795    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.623202  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  51.2 
 
 		 1295 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  39.94 
 
 		 1306 aa  896    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  56.19 
 
 		 1296 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  51.46 
 
 		 1345 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  56.01 
 
 		 1300 aa  637    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  43.04 
 
 		 1411 aa  774    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  45.01 
 
 		 1326 aa  1002    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  42.25 
 
 		 1325 aa  944    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  56.4 
 
 		 1293 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1419  ATP-dependent helicase HrpA  37.66 
 
 		 1421 aa  847    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.680764  normal  0.0419537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  42.49 
 
 		 1316 aa  960    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  100 
 
 		 1373 aa  2747    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  55.35 
 
 		 1295 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0283  ATP-dependent helicase HrpA  40.76 
 
 		 1394 aa  844    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  54.71 
 
 		 1295 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  39.45 
 
 		 1353 aa  847    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  57.61 
 
 		 1282 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  53.92 
 
 		 1318 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  42.31 
 
 		 1339 aa  916    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.03 
 
 		 1303 aa  641    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  43.5 
 
 		 1307 aa  974    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  56.82 
 
 		 1293 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  56.48 
 
 		 1293 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.48 
 
 		 1300 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  42.81 
 
 		 1341 aa  968    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  57.39 
 
 		 1308 aa  664    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  42.53 
 
 		 1290 aa  925    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  44.93 
 
 		 1326 aa  1008    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  39.94 
 
 		 1306 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  45.23 
 
 		 1374 aa  1012    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  39.94 
 
 		 1300 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  53.51 
 
 		 1318 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0113  ATP-dependent helicase HrpA  43.69 
 
 		 1560 aa  780    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00159234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  56.82 
 
 		 1293 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  38.13 
 
 		 1330 aa  806    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.48 
 
 		 1300 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  41.75 
 
 		 1331 aa  857    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  56.54 
 
 		 1296 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  56.73 
 
 		 1306 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  54.58 
 
 		 1312 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  53.65 
 
 		 1300 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.01 
 
 		 1306 aa  894    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  54.12 
 
 		 1291 aa  634  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  58.21 
 
 		 1290 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  53.61 
 
 		 1291 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  56.1 
 
 		 1324 aa  630  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  56.67 
 
 		 1293 aa  632  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  56.49 
 
 		 1291 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  55.94 
 
 		 1289 aa  631  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  56.67 
 
 		 1293 aa  632  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  54.53 
 
 		 1295 aa  629  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  52.08 
 
 		 1301 aa  629  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  54.14 
 
 		 1329 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  54.53 
 
 		 1295 aa  629  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  55.22 
 
 		 1291 aa  627  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  51.93 
 
 		 1301 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  55.12 
 
 		 1291 aa  625  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>