More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16270 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  58.87 
 
 		 1378 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  59.61 
 
 		 1345 aa  743    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.06 
 
 		 1300 aa  748    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  59.16 
 
 		 1295 aa  732    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  60.36 
 
 		 1291 aa  723    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  61.87 
 
 		 1308 aa  748    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  41.05 
 
 		 1478 aa  947    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  60.59 
 
 		 1291 aa  734    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  42.18 
 
 		 1441 aa  786    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  60.6 
 
 		 1281 aa  743    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  60.06 
 
 		 1300 aa  749    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  44.78 
 
 		 1293 aa  1073    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.06 
 
 		 1300 aa  749    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  74.69 
 
 		 1301 aa  1949    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  59.68 
 
 		 1462 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  61.15 
 
 		 1333 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  62.31 
 
 		 1294 aa  731    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  43.45 
 
 		 1331 aa  976    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  46.46 
 
 		 1375 aa  1182    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  60.66 
 
 		 1293 aa  738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  74.6 
 
 		 1303 aa  2009    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  81 
 
 		 1326 aa  2174    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.46 
 
 		 1306 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  44.57 
 
 		 1293 aa  1079    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  43.45 
 
 		 1351 aa  976    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  60.93 
 
 		 1295 aa  731    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  74.84 
 
 		 1301 aa  1969    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  47.64 
 
 		 1339 aa  1159    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4550  ATP-dependent helicase HrpA  41.11 
 
 		 1391 aa  951    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  75.13 
 
 		 1301 aa  1953    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  58.78 
 
 		 1298 aa  734    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  74.45 
 
 		 1303 aa  2011    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  42.3 
 
 		 1423 aa  982    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  55.79 
 
 		 1329 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  64.09 
 
 		 1324 aa  719    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  46.29 
 
 		 1323 aa  1082    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  45.78 
 
 		 1275 aa  1014    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  81.59 
 
 		 1338 aa  2192    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.46 
 
 		 1300 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  60.73 
 
 		 1281 aa  739    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  75.97 
 
 		 1303 aa  2023    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  59.16 
 
 		 1295 aa  732    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  45 
 
 		 1360 aa  1013    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  58.87 
 
 		 1402 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0980  ATP-dependent helicase HrpA  37.76 
 
 		 1307 aa  789    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  56.47 
 
 		 1342 aa  708    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  43.14 
 
 		 1329 aa  1033    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  57.89 
 
 		 1380 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  62.64 
 
 		 1295 aa  759    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  43.7 
 
 		 1355 aa  1020    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  48.03 
 
 		 1339 aa  1169    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2106  ATP-dependent helicase HrpA  42.33 
 
 		 1298 aa  940    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.426464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  59.97 
 
 		 1296 aa  713    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.23 
 
 		 1300 aa  750    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  58.93 
 
 		 1300 aa  731    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  35.63 
 
 		 1566 aa  761    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  41.15 
 
 		 1402 aa  754    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  58.49 
 
 		 1291 aa  722    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  42.31 
 
 		 1438 aa  993    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  50.61 
 
 		 1325 aa  1255    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  57.87 
 
 		 1320 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1419  ATP-dependent helicase HrpA  42.12 
 
 		 1421 aa  989    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.680764  normal  0.0419537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  45.09 
 
 		 1316 aa  1057    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.46 
 
 		 1306 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  48.57 
 
 		 1312 aa  1129    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  45.23 
 
 		 1373 aa  1018    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  74.98 
 
 		 1301 aa  1954    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  44.59 
 
 		 1282 aa  1124    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  37.22 
 
 		 1378 aa  818    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  58.24 
 
 		 1307 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  44.86 
 
 		 1293 aa  1081    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  58.25 
 
 		 1303 aa  715    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  42.2 
 
 		 1353 aa  964    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  60.66 
 
 		 1293 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  60.66 
 
 		 1293 aa  739    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  48.76 
 
 		 1341 aa  1187    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  59.43 
 
 		 1291 aa  723    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  60.84 
 
 		 1317 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  39.97 
 
 		 1466 aa  925    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  81.08 
 
 		 1326 aa  2174    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  43.89 
 
 		 1326 aa  1049    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.62 
 
 		 1306 aa  747    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  39.89 
 
 		 1309 aa  858    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3104  ATP-dependent helicase HrpA  45.38 
 
 		 1388 aa  956    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.623202  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  54.4 
 
 		 1305 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  46.36 
 
 		 1318 aa  1162    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  61.32 
 
 		 1293 aa  743    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.29 
 
 		 1309 aa  741    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.06 
 
 		 1300 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  47.39 
 
 		 1282 aa  1043    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  61.78 
 
 		 1289 aa  748    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  44.86 
 
 		 1293 aa  1082    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  45.79 
 
 		 1295 aa  1081    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  58.29 
 
 		 1296 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  61.2 
 
 		 1310 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  60.1 
 
 		 1312 aa  758    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  60.06 
 
 		 1300 aa  749    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  42.59 
 
 		 1306 aa  951    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  41.72 
 
 		 1341 aa  950    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  59.71 
 
 		 1306 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>