More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4550 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  43.41 
 
 		 1293 aa  1034    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  44.36 
 
 		 1295 aa  1068    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.41 
 
 		 1300 aa  1004    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  37.04 
 
 		 1478 aa  815    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.34 
 
 		 1300 aa  1004    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  42.98 
 
 		 1291 aa  1029    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01010  ATP-dependent helicase HrpA  38.42 
 
 		 1560 aa  852    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.573164  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  42.34 
 
 		 1281 aa  1005    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  42.41 
 
 		 1300 aa  1007    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  45.87 
 
 		 1297 aa  825    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  43.51 
 
 		 1293 aa  1029    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.41 
 
 		 1300 aa  1006    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0877  ATP-dependent helicase HrpA  72.38 
 
 		 1363 aa  1962    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0749842  normal  0.69744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  66.2 
 
 		 1351 aa  1805    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.37 
 
 		 1306 aa  1014    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  51.83 
 
 		 1331 aa  786    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2723  ATP-dependent helicase HrpA  74.29 
 
 		 1289 aa  1149    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  66 
 
 		 1353 aa  1783    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  57.81 
 
 		 1375 aa  1135    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  44.07 
 
 		 1293 aa  1048    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  43.89 
 
 		 1295 aa  1028    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  56.25 
 
 		 1375 aa  1433    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  56.25 
 
 		 1375 aa  1433    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  42.15 
 
 		 1306 aa  976    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  56.25 
 
 		 1375 aa  1433    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  41.72 
 
 		 1295 aa  1011    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2556  ATP-dependent helicase HrpA  76.53 
 
 		 1341 aa  2035    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0904088  hitchhiker  0.00638433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  56.94 
 
 		 1378 aa  1440    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  33.29 
 
 		 1566 aa  685    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.44 
 
 		 1300 aa  1015    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  56.5 
 
 		 1403 aa  1425    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  44.19 
 
 		 1295 aa  1041    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  34.23 
 
 		 1423 aa  767    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  50.47 
 
 		 1329 aa  1289    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  43.62 
 
 		 1291 aa  1037    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  52.17 
 
 		 1323 aa  805    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  62.92 
 
 		 1275 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  39.34 
 
 		 1331 aa  848    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  57.81 
 
 		 1375 aa  1133    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  41.48 
 
 		 1367 aa  909    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  68.44 
 
 		 1306 aa  1097    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  47.96 
 
 		 1300 aa  913    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.37 
 
 		 1306 aa  1013    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  56.09 
 
 		 1402 aa  1420    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  40.66 
 
 		 1438 aa  729    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  56.25 
 
 		 1375 aa  1433    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  55.97 
 
 		 1462 aa  1440    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.59 
 
 		 1295 aa  912    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  56.09 
 
 		 1380 aa  1434    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  40.52 
 
 		 1355 aa  915    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  63.93 
 
 		 1411 aa  636    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  41.67 
 
 		 1373 aa  742    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2106  ATP-dependent helicase HrpA  69.55 
 
 		 1298 aa  1139    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.426464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  44.3 
 
 		 1324 aa  814    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  36.76 
 
 		 1466 aa  798    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  44.4 
 
 		 1376 aa  911    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  68.7 
 
 		 1402 aa  1922    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  55.01 
 
 		 1428 aa  1430    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  43.33 
 
 		 1291 aa  1025    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  56.35 
 
 		 1298 aa  1408    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  51.78 
 
 		 1333 aa  800    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.37 
 
 		 1306 aa  1014    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  41.96 
 
 		 1374 aa  932    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1419  ATP-dependent helicase HrpA  34.33 
 
 		 1421 aa  773    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.680764  normal  0.0419537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  51.02 
 
 		 1316 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4550  ATP-dependent helicase HrpA  100 
 
 		 1391 aa  2830    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  41.79 
 
 		 1307 aa  890    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  56.82 
 
 		 1402 aa  1423    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.37 
 
 		 1306 aa  1014    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  49.08 
 
 		 1295 aa  924    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  56.11 
 
 		 1375 aa  1431    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.34 
 
 		 1300 aa  1003    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  38.75 
 
 		 1361 aa  650    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  41.01 
 
 		 1303 aa  974    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  41.27 
 
 		 1317 aa  895    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  44.14 
 
 		 1293 aa  1054    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  44.19 
 
 		 1293 aa  1048    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  42.37 
 
 		 1291 aa  1025    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  43.63 
 
 		 1341 aa  1015    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  43.44 
 
 		 1291 aa  1055    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  43.7 
 
 		 1293 aa  1036    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  55.68 
 
 		 1222 aa  1321    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  85.26 
 
 		 1341 aa  2311    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1546  ATP-dependent helicase HrpA  85.12 
 
 		 1341 aa  2309    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  55.22 
 
 		 1320 aa  1445    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  56.82 
 
 		 1314 aa  1423    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  38.07 
 
 		 1309 aa  839    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  60 
 
 		 1330 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  39.63 
 
 		 1305 aa  882    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.41 
 
 		 1300 aa  1007    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  44.07 
 
 		 1293 aa  1051    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  43.62 
 
 		 1293 aa  1037    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.46 
 
 		 1290 aa  962    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  41.33 
 
 		 1282 aa  888    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  41.63 
 
 		 1312 aa  923    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  43.14 
 
 		 1303 aa  981    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.51 
 
 		 1300 aa  1005    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  43.27 
 
 		 1310 aa  1045    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  42.03 
 
 		 1310 aa  903    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  55.39 
 
 		 1310 aa  1424    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>